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Enregistrement W2140673748 · doi:10.1094/pdis-02-14-0175-pdn

First Report of Anthracnose Caused by <i>Colletotrichum lupini</i> on Yellow Lupin in Korea

2014· article· en· W2140673748 sur OpenAlexaboutno aff
K. S. Han, Byung–Sup Kim, In‐Young Choi, J. H. Park, H. D. Shin

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésConidiumBiologySpotsHerbariumOrnamental plantBractBotanyPowdery mildewHorticulturePycnidiumInflorescence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Yellow lupin (Lupinus luteus L.) is native to the Mediterranean region of southern Europe. In Korea, yellow lupins are cultivated for ornamental purposes. In May 2013, hundreds of yellow lupins that were grown in pots for 7 weeks in polyethylene-film-covered greenhouses were observed severely damaged by a previously unknown disease with about 30% disease incidence in a flower farm in Yongin City, Korea. Voucher specimens were deposited in the Korea University Herbarium (KUS). Early symptoms on petioles and stems appeared as small, slightly sunken, water-soaked, and circular spots. Lesions increased in size (4 to 12 μm in diameter), became more depressed, with a darkened central portion. As the disease progressed, affected areas sometimes girdled the stem and killed the shoot. Leaves were partly blighted, but less damaged. The darkened areas contained blackish acervuli from which masses of pale salmon-colored conidia were released in moist weather. Acervuli were circular to ellipsoid, 80 to 400 μm in diameter. Acervular setae were not observed. Conidia (n = 30) were long obclavate to oblong-elliptical, aguttulate, hyaline, and 10 to 18 × 3.6 to 5.2 μm with a length/width ratio of 2.6 to 3.6. Appressoria were single or occasionally in small dense clusters, medium brown, elliptical to round in outline with a smooth to lobate margin, and 8 to 14 × 6 to 9 μm. These characters were consistent with the description of Colletotrichum lupini (Bondar) Damm, P.F. Cannon & Crous (1,3). An isolate was deposited in the Korean Agricultural Culture Collection (Accession No. KACC47254). Fungal DNA was extracted with DNeasy Plant Mini DNA Extraction Kits (Qiagen Inc., Valencia, CA). The complete internal transcribed spacer (ITS) region of rDNA was amplified with the primers ITS1/ITS4 and sequenced. The resulting 545-bp sequence was deposited in GenBank (Accession No. KJ447119). The sequence showed 100% identity with sequences of C. lupini (e.g., GenBank AJ301968, JN943480, JQ948162, and KF207599). To confirm pathogenicity, inoculum was prepared by harvesting conidia with sterile distilled water from 3-week-old cultures on potato dextrose agar. A conidial suspension (2 × 105 conidia/ml) was sprayed until runoff onto the aerial parts of five healthy plants. Control plants were sprayed with sterile water. The plants were covered with plastic bags to maintain a relative humidity of 100% for 48 h and then transferred to a greenhouse. Typical symptoms of necrotic spots appeared on the inoculated leaves 6 days after inoculation, and were identical to the ones observed in the field. C. lupini was re-isolated from symptomatic leaf tissues. No symptoms were observed on control plants. The pathogenicity test was repeated twice. Anthracnose associated with C. lupini on lupins has been known from Europe (Germany, Ukraine, Austria, and Netherlands), North America (Canada and the United States), South America (Bolivia and Brazil), and Oceania (Australia and New Zealand) (2,4). To our knowledge, this is the first report of C. lupini on yellow lupins in Asia as well as in Korea. The presence of C. lupini on lupins in Asia can be considered as a potentially new and serious threat to this ornamental plant. References: (1) U. Damm et al. Stud. Mycol. 73:37, 2012. (2) D. F. Farr and A. Y. Rossman. Fungal Databases. Syst. Mycol. Microbiol. Lab., Online publication, ARS, USDA, Retrieved February 17, 2014. (3) H. I. Nirenberg et al. Mycologia 94:307, 2002. (4) E. Rosskopf et al. Plant Dis. 98:161, 2014.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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