<i>Fusobacterium nucleatum</i> infection is prevalent in human colorectal carcinoma

2011· article· en· 2 063 citations· W2140679462 sur OpenAlex· 10.1101/gr.126516.111

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,096

Tête enseignante GPT0,358

Écart entre enseignants: 0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation: score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

An estimated 15% or more of the cancer burden worldwide is attributable to known infectious agents. We screened colorectal carcinoma and matched normal tissue specimens using RNA-seq followed by host sequence subtraction and found marked over-representation of Fusobacterium nucleatum sequences in tumors relative to control specimens. F. nucleatum is an invasive anaerobe that has been linked previously to periodontitis and appendicitis, but not to cancer. Fusobacteria are rare constituents of the fecal microbiota, but have been cultured previously from biopsies of inflamed gut mucosa. We obtained a Fusobacterium isolate from a frozen tumor specimen; this showed highest sequence similarity to a known gut mucosa isolate and was confirmed to be invasive. We verified overabundance of Fusobacterium sequences in tumor versus matched normal control tissue by quantitative PCR analysis from a total of 99 subjects (p = 2.5 × 10(-6)), and we observed a positive association with lymph node metastasis.

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La notice

Revue: Genome Research
Thématique: Otolaryngology and Infectious Diseases
Domaine: Medicine
Établissements canadiens: Canada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of GuelphSimon Fraser UniversityBC Cancer Agency
Organismes subventionnaires: Canadian Institutes of Health ResearchGenome British Columbia
Mots-clés: Fusobacterium nucleatumFusobacteriaFusobacteriumBiologyColorectal cancerPathologyCarcinomaBacteroidaceaeMicrobiologyCancerBacteroidesMedicineBacteria16S ribosomal RNAGenetics
Résumé présent dans OpenAlex: oui
API: /api/v1/works/W2140679462