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Enregistrement W2140697563 · doi:10.1093/eurheartj/ehn520

Transcriptional profiling of ion channel genes in Brugada syndrome and other right ventricular arrhythmogenic diseases

2008· article· en· W2140697563 sur OpenAlexaff
Nathalie Gaborit, Thomas Wichter, András Varró, Viktória Szüts, Guillaume Lamirault, Lars Eckardt, Matthias Paul, Günter Breithardt, Eric Schulze‐Bahr, Denis Escande, Stanley Nattel, Sophie Demolombe

Notice bibliographique

RevueEuropean Heart Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésBrugada syndromeMedicineInternal medicineCardiologyProbandSudden cardiac deathVentricular tachycardiaRyanodine receptor 2RepolarizationGeneGeneticsMutationElectrophysiologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: Brugada syndrome is an inherited sudden-death arrhythmia syndrome. Na(+)-current dysfunction is central, but mutations in the SCN5A gene (encoding the cardiac Na(+)-channel Nav1.5) are present in only 20% of probands. This study addressed the possibility that Brugada patients display specific expression patterns for ion-channels regulating cardiac conduction, excitability, and repolarization. METHODS AND RESULTS: Transcriptional profiling was performed on right-ventricular endomyocardial biopsies from 10 unrelated Brugada probands, 11 non-diseased organ-donors, seven heart-transplant recipients, 10 with arrhythmogenic right-ventricular cardiomyopathy, and nine with idiopathic right-ventricular outflow-tract tachycardia. Brugada patients showed distinct clustering differences vs. the two control and two other ventricular-tachyarrhythmia groups, including 14 of 77 genes encoding important ion-channel/ion-transporter subunits. Nav1.5 and K(+)-channels Kv4.3 and Kir3.4 were more weakly expressed, whereas the Na(+)-channel Nav2.1 and the K(+)-channel TWIK1 were more strongly expressed, in Brugada syndrome. Differences were also seen in Ca(2+)-homeostasis transcripts, including stronger expression of RYR2 and NCX1. The molecular profile of Brugada patients with SCN5A mutations did not differ from Brugada patients without SCN5A mutations. CONCLUSION: Brugada patients exhibit a common ion-channel molecular expression signature, irrespective of the culprit gene. This finding has potentially important implications for our understanding of the pathophysiology of Brugada syndrome, with possible therapeutic and diagnostic consequences.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,302
Score d'incertitude au seuil0,349

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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