The<scp>SEPALLATA MADS</scp>‐box protein<scp>SLMBP</scp>21 forms protein complexes with<scp>JOINTLESS</scp>and<scp>MACROCALYX</scp>as a transcription activator for development of the tomato flower abscission zone
Notice bibliographique
Résumé
Organ abscission is a key step in a plant's life cycle and is one of the most important agronomic traits for crops. In tomato, two MADS-box genes, JOINTLESS (J) and MACROCAYLYX (MC), have been shown to be implicated in development of the flower abscission zone (AZ), but the molecular mechanisms underlying this process are not well known. We report here that the SEPALLATA (SEP) MADS-box gene SLMBP21 acts as an additional factor for development of the AZ in tomato. We show that knockdown of SLMBP21 abolishes development of the flower AZ, while overexpression of SLMBP21 produces small cells at the proximal section of the pedicel and the peduncle. Bimolecular fluorescence complementation analysis confirms that SLMBP21 interacts with J and MC, and co-immunoprecipitation assays further demonstrates that these three proteins may form higher-order protein complexes. In situ hybridization shows that SLMBP21, J, and MC transcripts accumulate in distinct regions, but overlap at the AZ vasculature. In addition, transactivation assays in yeast show that, of the three interacting proteins, only SLMBP21 can activate reporter gene transcription. RNA-seq analysis furthermore reveals that loss of function of SLMBP21, J, or MC affects a common subset of meristem activity genes including LeWUS and LATERAL SUPPRESSOR that were specifically expressed in the AZ on the tomato flower pedicel. Since SLMBP21 belongs to the FBP9/23 subclade of the SEP gene family, which is absent in Arabidopsis, the SLMBP21-J-MC complex may represent a distinct mechanism for development of the AZ in plants.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».