X‐chromosome inactivation (XCI) patterns in placental tissues of a paternally derived bal t(X;20) case
Notice bibliographique
Résumé
Non-random X-chromosome inactivation (XCI) is often seen in female carriers of balanced X-autosome translocations and is generally attributed to a selective growth of cells that inactivate the normal X chromosome. However, little is known concerning when in development the selection acts, and thus whether skewed XCI would also be seen in placental tissues. Furthermore, as males with X-autosome translocations are normally infertile, all translocations studied to date for XCI-skewing have been either maternal or de novo in origin. We now present an analysis of XCI status in cord blood, umbilical cord and four different extraembryonic tissues from a female carrier of a paternally derived balanced (X;20) translocation. Using methylation based assays to determine XCI status, we found preferential inactivation of the non-translocated X in cord blood, umbilical cord and amnion samples of the propositus. Remarkably, random XCI was evident in several placental tissues analyzed (chorion, and chorionic villi trophoblast and mesenchyme). While these findings support the hypothesis of strong selection against cells with an inactive translocated X-chromosome in most embryonic/fetal tissues, they also suggest weaker selective forces taking place during placental development. Additionally, the finding of normal placental development in the present case, rules out the possibility of a parental bias to XCI in human extraembryonic tissues as a requisite for normal development. The finding of hypomethylation in extraembryonic tissues for two out of three markers used in the study is consistent with previous findings demonstrating low levels of methylation in these tissues.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».