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Enregistrement W2140777372 · doi:10.1158/1541-7786.mcr-07-2001

BRAF Silencing by Short Hairpin RNA or Chemical Blockade by PLX4032 Leads to Different Responses in Melanoma and Thyroid Carcinoma Cells

2008· article· en· W2140777372 sur OpenAlexaff
Elisa Sala, Luca Mologni, Silvia Truffa, Carlo Gaetano, Gideon Bollag, Carlo Gambacorti‐Passerini

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMelanoma and MAPK Pathways
Établissements canadiensConcordia UniversityMcGill University
Organismes subventionnairesPlexxikon
Mots-clésCancer researchGene silencingThyroid cancerSmall hairpin RNAMelanomaThyroid carcinomaCancerBiologyAnaplastic thyroid cancerGene knockdownCell growthRNA interferenceCell cultureMedicineThyroidInternal medicineEndocrinologyRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BRAF-activating mutations have been reported in several types of cancer, including melanoma ( approximately 70% of cases), thyroid (30-70%), ovarian (15-30%), and colorectal cancer (5-20%). Mutant BRAF has constitutive kinase activity and causes hyperactivation of the mitogen-activated protein kinase pathway. BRAF silencing induces regression of melanoma xenografts, indicating the essential role of BRAF for cell survival. We set up an inducible short hairpin RNA system to compare the role of oncogenic BRAF in thyroid carcinoma versus melanoma cells. Although BRAF knockdown led to apoptosis in the melanoma cell line A375, the anaplastic thyroid carcinoma cell ARO underwent growth arrest upon silencing, with little or no cell death. Reexpression of the thyroid differentiation marker, sodium iodide symporter, was induced after long-term silencing. The different outcome of BRAF down-regulation in the two cell lines was associated with an opposite regulation of p21(CIP1/WAF1) expression levels in response to the block of the BRAF mitogenic signal. These results were confirmed using a specific BRAF small-molecule inhibitor, PLX4032. Restoration of p21(CIP1/WAF1) expression rescued melanoma cells from death. Altogether, our data indicate that oncogenic BRAF inhibition can have a different effect on cell fate depending on the cellular type. Furthermore, we suggest that a BRAF-independent mechanism of cell survival exists in anaplastic thyroid cancer cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations187
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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