MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2140885850 · doi:10.1111/jbi.12394

A similar phylogeographical structure among sympatric North American birches (<i>Betula</i>) is better explained by introgression than by shared biogeographical history

2014· article· en· W2140885850 sur OpenAlexafffund
Ashley M. Thomson, Christopher W. Dick, Selvadurai Dayanandan

Notice bibliographique

RevueJournal of Biogeography · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaConcordia UniversityNational Science Foundation
Mots-clésRefugium (fishkeeping)BiologyIntrogressionPhylogeographyEcologyYellow birchPhylogenetic treeHabitatGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aim A comparative analysis of the chloroplast (cp) DNA structure of eastern North American birches ( Betula ) was undertaken to infer the impacts of Quaternary climate change on the phylogeographical structure of these species. Location Eastern North America. Methods Genetic variation in chloroplast microsatellites (cp SSR s) and the psb A– trn H intergenic spacer in Betula papyrifera , Betula alleghaniensis and Betula lenta was analysed in samples from 65, 80 and 12 populations, respectively. Co‐occurring Betula uber , Betula populifolia and Betula cordifolia were also sampled to examine haplotype relationships and account for potential introgression. Haplotype networks, Bayesian analysis and comparisons of R ST and G ST values were used to evaluate the phylogeographical structure. Genetic diversity within and among species was compared using rarefaction analysis. Results The two most widespread species, B. papyrifera and B. alleghaniensis , showed high levels of haplotype diversity, while the Appalachian endemic B. lenta possessed a single haplotype. Bayesian analysis revealed three main phylogeographical groups for B. papyrifera and four groups for B. alleghaniensis , and these two species showed extensive regional haplotype sharing and a high introgression ratio. Main conclusions We postulate that at least three separate refugia contributed to the recolonization of B. papyrifera and B. alleghaniensis within eastern North America, while B. lenta appears to have recolonized from a single refugium. A high haplotype diversity of B. papyrifera and B. alleghaniensis in the Great Lakes region may reflect biogeographical contact between eastern and western lineages, with the potential influence of periglacial refugia. Similar phylogeographical patterns in the distantly related B. papyrifera and B. alleghaniensis represent a geographical turnover of the same locally shared haplotypes, pointing to introgression rather than shared biogeographical history as the mechanism. Although similar phylogeographical patterns are often interpreted as evidence for common biogeographical histories, our study demonstrates that such patterns can also arise through introgression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,108
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of BiogeographyMême sujetGenetic diversity and population structureTravaux en français237 207