Structure-Guided Identification of C3d Residues Essential for Its Binding to Complement Receptor 2 (CD21)
Notice bibliographique
Résumé
A vital role for complement in adaptive humoral immunity is now beyond dispute. The crucial interaction is that between B cell and follicular dendritic cell-resident complement receptor 2 (CR2, CD21) and its Ag-associated ligands iC3b and C3dg, where the latter have been deposited as a result of classical pathway activation. Despite the obvious importance of this interaction, the location of a CR2 binding site within C3d, a proteolytic limit fragment of C3dg retaining CR2 binding activity, has not been firmly established. The recently determined x-ray structure of human C3d suggested a candidate site that was remote from the site of covalent attachment to Ag and consisted of an acidic residue-lined depression, which accordingly displays a significant electronegative surface potential. These attributes were consistent with the known ionic strength dependence of the CR2-C3d interaction and with the fact that a significant electropositive surface was apparent in a modeled structure of the C3d-binding domains of CR2. Therefore, we have performed an alanine scan of all of the residues within and immediately adjacent to the acidic pocket in C3d. By testing the mutant iC3b molecules for their ability to bind CR2, we have identified two separate clusters of residues on opposite sides of the acidic pocket, specifically E37/E39 and E160/D163/I164/E166, as being important CR2-contacting residues in C3d. Within the second cluster even single mutations cause near total loss of CR2 binding activity. Consistent with the proposed oppositely charged nature of the interface, we have also found that removal of a positive charge immediately adjacent to the acidic pocket (mutant K162A) results in a 2-fold enhancement in CR2 binding activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».