Distribution and Characteristics of <i>Listeria monocytogenes</i> Isolates from Surface Waters of the South Nation River Watershed, Ontario, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Listeria monocytogenes is a facultative intracellular pathogen thought to be widely distributed in the environment. We investigated the prevalence and characteristics of L. monocytogenes isolates from surface waters derived from catchments within the South Nation River watershed (Ontario, Canada). This watershed is dominated by urban and rural development, livestock and crop production, and wildlife habitats. From June to November 2005, a total of 314 surface water samples were collected biweekly from 22 discrete sampling sites characterized by various upstream land uses. Presumptive Listeria spp. were isolated using a selective enrichment and isolation procedure, and 75 L. monocytogenes isolates were identified based on colony morphology, hemolytic activity, and amplification of three pathogenicity genes: iap, inlA, and hlyA. Thirty-two of 314 (10%) surface water samples were positive for the presence of L. monocytogenes, but detection ranged between 0 and 27% depending on the sampling date. Isolates belonging to serovar group 1/2a, 3a (50%) and group 4b, 4d, 4e (32%) were dominant. L. monocytogenes populations were resolved into 13 EcoRI ribotypes and 21 ApaI and 21 AscI pulsotypes. These had Simpson indexes of discrimination of up to 0.885. Lineage I-related isolates were dominant (61%) during the summer, whereas lineage II isolates were dominant (77%) in the fall. Isolates were, on average, resistant to 6.1 +/- 2.1 antibiotics out of 17 tested. Half of the L. monocytogenes isolates exhibited potential virulence linked to the production of a functional internalin A, and some isolates were found to be moderately to highly virulent by in vitro Caco-2 plaque formation assay (up to 28% of entry). There was a statistically significant link between the occurrence of L. monocytogenes and proximity to an upstream dairy farm and degree of cropped land. Our data indicate that L. monocytogenes is widespread in the studied catchments, where it could represent a public health issue related to agricultural land use.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».