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Enregistrement W2141176301 · doi:10.1128/iai.00985-06

SseL Is a <i>Salmonella</i> -Specific Translocated Effector Integrated into the SsrB-Controlled <i>Salmonella</i> Pathogenicity Island 2 Type III Secretion System

2006· article· en· W2141176301 sur OpenAlexafffund
Brian K. Coombes, Michael J. Lowden, Jennifer L. Bishop, Mark E. Wickham, Nat F. Brown, Nancy Duong, Suzanne E. Osborne, Ohad Gal‐Mor, B. Brett Finlay

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British ColumbiaMcMaster UniversityPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BCPublic Health AgencyPublic Health Agency of CanadaMcMaster University
Mots-clésPathogenicity islandVirulenceBiologyType three secretion systemSalmonellaSalmonella entericaSecretionEffectorMicrobiologyPathogenGeneGeneticsBacteriaCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacterial pathogens use horizontal gene transfer to acquire virulence factors that influence host colonization, alter virulence traits, and ultimately shape the outcome of disease following infection. One hallmark of the host-pathogen interaction is the prokaryotic type III secretion system that translocates virulence factors into host cells during infection. Salmonella enterica possesses two type III secretion systems that are utilized during host colonization and intracellular replication. Salmonella pathogenicity island 2 (SPI2) is a genomic island containing approximately 30 contiguous genes required to assemble a functional secretion system including the two-component regulatory system called SsrA-SsrB that positively regulates transcription of the secretion apparatus. We used transcriptional profiling with DNA microarrays to search for genes that coregulate with the SPI2 type III secretion machinery in an SsrB-dependent manner. Here we report the identification of a Salmonella-specific translocated effector called SseL that is required for full virulence during murine typhoid-like disease. Analysis of infected macrophages using fluorescence-activated cell sorting revealed that sseL is induced inside cells and requires SsrB for expression. SseL is retained predominantly in the cytoplasm of infected cells following translocation by the type III system encoded in SPI2. Animal infection experiments with sseL mutant bacteria indicate that integration of SseL into the SsrB response regulatory system contributes to systemic virulence of this pathogen.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,905
Score d'incertitude au seuil0,986

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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