Interactions and relationships of <i>PTEN</i>, <i>ERG</i>, <i>SPINK1</i> and <i>AR</i> in castration‐resistant prostate cancer
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: Recently, ETS-related gene (ERG) gene rearrangements, phosphatase tensin homologue (PTEN) deletions and serine protease inhibitor Kazal type 1 (SPINK1) overexpression were investigated as potential markers for molecularly subtyping prostate cancer (PCA). However, their incidence and co-association in castration-resistant PCA (CRPC) has not been characterized fully. METHODS AND RESULTS: A cohort of 59 CRPC patients was investigated for ERG rearrangements, PTEN deletions and androgen receptor (AR) amplification by fluorescence in-situ hybridization. SPINK1 overexpression was assessed by immunohistochemistry. ERG rearrangements and PTEN deletions were detected in 22 of 53 (41.5%) and 35 of 55 (63.6%) of cases, with 15 of 22 (68.1%) of ERG rearrangements occurring through deletions. SPINK1 overexpression occurred in three of 51 (5.8%) of cases exclusively in non-ERG rearranged and AR amplification was detected in 12 of 49 (24.4%) of cases. Only PTEN deletions showed intrafocal heterogeneity occurring in nine of 35 (25.7%) of cases. PTEN deletions were significantly associated with each of ERG rearrangements occurring by deletions only (P = 0.001), AR amplification (P = 0.002) and SPINK1 overexpression (P = 0.002). None of the SPINK1 overexpressing tumours showed AR amplification (P = 0.005) and all occurred in PTEN deleted foci (P = 0.002). CONCLUSION: Te study supports the heterogeneous nature of CRPC and confirms a significant association between PTEN, ERG, AR and SPINK1. Characterizing combined markers will aid in defining PCA subgroups relevant to prognosis contributing to the design of improved therapeutic approaches for CRPC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».