MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2141471559 · doi:10.1210/en.2008-0107

Functional Significance of a Truncated Thyroid Receptor Subtype Lacking a Hormone-Binding Domain in Goldfish

2008· article· en· W2141471559 sur OpenAlexaff
Erik R. Nelson, Hamid R. Habibi

Notice bibliographique

RevueEndocrinology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThyroid hormone receptorThyroid hormone receptor betaBiologyThyroid hormone receptor alphaThyroidNuclear receptorInternal medicineEndocrinologyGene expressionReceptorGeneHormoneDeiodinaseMolecular biologyHormone receptorTranscription factorGeneticsTriiodothyronineMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Thyroid hormones are important mediators of growth and development in vertebrates and act by binding to a specific family of thyroid receptors (TRs). The TRs belong to the nuclear receptor superfamily, with two conserved regions, a DNA binding domain and a ligand binding domain (LBD). We recently demonstrated the presence of four TR subtypes in goldfish, two with complete DNA binding domains and LBDs (TRalpha-1 and TRbeta) and two novel forms including a transcript resembling TRalpha with variation in the LBD as well as a TRalpha-truncated (TRalpha-t) form lacking a LBD. To study the functional significance of TR subtypes, we first investigated the regulation of hepatic goldfish deiodinase type 3 (D3) by T3 and validated a bioassay in which D3 gene expression is up-regulated significantly in vivo and in vitro. Using short interfering RNA, TRalpha-1, TRbeta, or TRalpha-t was specifically knocked down and thyroid hormone-induced D3 gene expression was measured. Short interfering RNA against TRalpha-1 or TRbeta reduced the T3 induction of deiodinase gene expression to 50% or less than 25% of control (T3 treated) cells, respectively. Knocking down TRalpha-t alone, however, increased D3 expression 500-fold supporting the hypothesis that TRalpha-t plays a modulatory role in thyroid hormone-induced gene expression. Our results provide important insight into thyroid receptor biology in goldfish and a framework for the better understanding of thyroid receptor function in all vertebrates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEndocrinologyMême sujetGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal AbnormalitiesTravaux en français237 207