Cell cycle–dependent transcription factors control the expression of yeast telomerase RNA
Notice bibliographique
Résumé
Telomerase is a specialized ribonucleoprotein that adds repeated DNA sequences to the ends of eukaryotic chromosomes to preserve genome integrity. Some secondary structure features of the telomerase RNA are very well conserved, and it serves as a central scaffold for the binding of associated proteins. The Saccharomyces cerevisiae telomerase RNA, TLC1, is found in very low copy number in the cell and is the limiting component of the known telomerase holoenzyme constituents. The reasons for this low abundance are unclear, but given that the RNA is very stable, transcriptional control mechanisms must be extremely important. Here we define the sequences forming the TLC1 promoter and identify the elements required for its low expression level, including enhancer and repressor elements. Within an enhancer element, we found consensus sites for Mbp1/Swi4 association, and chromatin immunoprecipitation (ChIP) assays confirmed the binding of Mbp1 and Swi4 to these sites of the TLC1 promoter. Furthermore, the enhancer element conferred cell cycle-dependent regulation to a reporter gene, and mutations in the Mbp1/Swi4 binding sites affected the levels of telomerase RNA and telomere length. Finally, ChIP experiments using a TLC1 RNA-binding protein as target showed cell cycle-dependent transcription of the TLC1 gene. These results indicate that the budding yeast TLC1 RNA is transcribed in a cell cycle-dependent fashion late in G1 and may be part of the S phase-regulated group of genes involved in DNA replication.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».