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Enregistrement W2141622431 · doi:10.1111/tpj.12859

A two‐component enzyme complex is required for dolichol biosynthesis in tomato

2015· article· en· W2141622431 sur OpenAlexafffund
Megan I. Brasher, Liliana Surmacz, Bryan J. Leong, Jocelyn Pitcher, Ewa Świeżewska, Eran Pichersky, Tariq A. Akhtar

Notice bibliographique

RevueThe Plant Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNarodowe Centrum NaukiNational Science Foundation
Mots-clésDolicholEndoplasmic reticulumBiochemistryBiosynthesisYeastMutantBiologyImmunoprecipitationGlycosylationCell biologyEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dolichol plays an indispensable role in the N-glycosylation of eukaryotic proteins. As proteins enter the secretory pathway they are decorated by a 'glycan', which is preassembled onto a membrane-anchored dolichol molecule embedded within the endoplasmic reticulum (ER). Genetic and biochemical evidence in yeast and animals indicate that a cis-prenyltransferase (CPT) is required for dolichol synthesis, but also point to other factor(s) that could be involved. In this study, RNAi-mediated suppression of one member of the tomato CPT family (SlCPT3) resulted in a ~60% decrease in dolichol content. We further show that the involvement of SlCPT3 in dolichol biosynthesis requires the participation of a distantly related partner protein, designated as CPT-binding protein (SlCPTBP), which is a close homolog of the human Nogo-B receptor. Yeast two-hybrid and co-immunoprecipitation assays demonstrate that SlCPT3 and its partner protein interact in vivo and that both SlCPT3 and SlCPTBP are required to complement the growth defects and dolichol deficiency of the yeast dolichol mutant, rer2∆. Co-expression of SlCPT3 and SlCPTBP in yeast and in E. coli confirmed that dolichol synthase activity strictly requires both proteins. Finally, organelle isolation and in vivo localization of fluorescent protein fusions showed that both SlCPT3 and SlCPTBP localize to the ER, the site of dolichol accumulation and synthesis in eukaryotes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,520

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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