MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2141652419 · doi:10.1126/science.287.5461.2185

The Genome Sequence of <i>Drosophila melanogaster</i>

2000· article· en· W2141652419 sur OpenAlexaff
Mark D. Adams, S Celniker, Robert A. Holt, Cheryl Evans, Jeannine D. Gocayne, Peter G. Amanatides, Steven E. Scherer, Peter W. Li, Roger A. Hoskins, Richard F. Galle, Reed George, Suzanna Lewis, Stephen M. Richards, Michael Ashburner, Scott N. Henderson, Granger G. Sutton, Jennifer R. Wortman, Mark Yandell, Qing Zhang, Lin X. Chen, Rhonda Brandon, Yu-Hui C. Rogers, Robert G. Blazej, Mark Champe, Barret D. Pfeiffer, Kenneth H. Wan, Clare Doyle, Evan G. Baxter, Gregg Helt, Catherine R. Nelson, George L. Gabor, Miklós, Josep F. Abril, Anna Agbayani, Hui-Jin An, Cynthia Andrews‐Pfannkoch, Danita Baldwin, Richard M. Ballew, Anand Basu, James Baxendale, Leyla Bayraktaroglu, Ellen M. Beasley, Karen Beeson, Panayiotis V. Benos, Benjamin P. Berman, Deepali Bhandari, Slava Bolshakov, Dana Borkova, Michael R. Botchan, John Bouck, Peter Brokstein, Phillipe Brottier, Kenneth C. Burtis, Dana Busam, H. Butler, Édouard Cadieu, Ishwar Chandra, J. Michael Cherry, Simon Cawley, Carl Dahlke, Lionel B. Davenport, Peter L. Davies, Beatriz de Pablos, Arthur L. Delcher, Zuoming Deng, Anne Deslattes Mays, Ian Dew, Suzanne M. Dietz, Kristina Dodson, Lisa Doup, Michael Downes, Shannon Dugan-Rocha, Boris C. Dunkov, Patrick Dunn, Kenneth J. Durbin, Carlos Evangelista, Concepción Ferraz, Steven Ferriera, Wolfgang Fleischmann, Carl Fosler, Andrei Gabrielian, Neha Garg, William M Gelbart, Ken Glasser, Anna Glodek, Fangcheng Gong, James H. Gorrell, Zhiping Gu, Ping Guan, Michael A. Harris, Nomi L. Harris, Damon A. Harvey, Thomas J. Heiman, Judith Hernandez, Jarrett Houck, Damon Hostin, Kathryn A. Houston, Timothy J. Howland, Chinyere Ibegwam, Mena Jalali, Francis Kalush, Gary H. Karpen, Zhaoxi Ke, James A. Kennison, Karen A. Ketchum, Bruce E. Kimmel, Chinnappa D. Kodira, Cheryl Kraft, Saul Kravitz, David Kulp, Zhongwu Lai, Paul Lasko, Yiding Lei, Alexander A. Levitsky, Jiayin Li, Zhenya Li, Yong Liang, Xiaoying Lin, Xiangjun Liu, Bettina Mattei, Tina C. McIntosh, Michael P. McLeod, D McPherson, Gennady V. Merkulov, Natalia V. Milshina, Clark Mobarry, Joe Morris, Ali Moshrefi, Stephen M. Mount, Mee Moy, Brian J. Murphy, Lee Murphy, Donna M. Muzny, David L. Nelson, David R. Nelson, Keith A. Nelson, Katherine Nixon, Deborah Nusskern, Joanne Pacleb, Michael Palazzolo, Gjange S. Pittman, Sue Pan, John R. Pollard, Vinita Puri, Martin G. Reese, Knut Reinert, Karin Remington, Robert D. C. Saunders, Frederick Scheeler, Hua Shen, Bixiang Christopher Shue, Inga Sidén‐Kiamos, Michael A. Simpson, Marian Skupski, Tom Smith, Eugene G. Spier, Allan C. Spradling, Mark Stapleton, Renee Strong, Eric I. Sun, Robert Svirskas, Cyndee Tector, Russell Turner, Eli Venter, Aihui H. Wang, Xin Wang, Zhenyuan Wang, David A. Wassarman, George M. Weinstock, Jean Weissenbach, Sherita M. Williams, Trevor Woodage, Kim C. Worley, David Wu, Song Yang, Qingping Yao, Jane J. Ye, Ru‐Fang Yeh, Jayshree Zaveri, Ming Zhan, Guangren Zhang, Qi Zhao, Liansheng Zheng, Xiangqun Zheng-Bradley, Fei Zhong, Wenyan Zhong, Xiaojun Zhou, Shiaoping C. Zhu, Hamilton O. Smith, Richard A. Gibbs, Eugene W. Myers, Gerald M. Rubin, J. Craig Venter

Notice bibliographique

RevueScience · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologyGenomeGeneticsDrosophila melanogasterGenome projectEuchromatinWhole genome sequencingCaenorhabditis elegansGeneComputational biologyChromosomeHeterochromatin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The fly Drosophila melanogaster is one of the most intensively studied organisms in biology and serves as a model system for the investigation of many developmental and cellular processes common to higher eukaryotes, including humans. We have determined the nucleotide sequence of nearly all of the approximately 120-megabase euchromatic portion of the Drosophila genome using a whole-genome shotgun sequencing strategy supported by extensive clone-based sequence and a high-quality bacterial artificial chromosome physical map. Efforts are under way to close the remaining gaps; however, the sequence is of sufficient accuracy and contiguity to be declared substantially complete and to support an initial analysis of genome structure and preliminary gene annotation and interpretation. The genome encodes approximately 13,600 genes, somewhat fewer than the smaller Caenorhabditis elegans genome, but with comparable functional diversity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6 026
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScienceMême sujetGenomics and Phylogenetic StudiesTravaux en français237 207