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Enregistrement W2141724967 · doi:10.1113/jphysiol.2013.265264

Rebuttal from Sergei N. Orlov, Michael M. Model and Ryszard Grygorczyk

2013· letter· en· W2141724967 sur OpenAlexaff
Sergei N. Orlov, Michael A. Model, Ryszard Grygorczyk

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physiology · 2013
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésApoptosisProgrammed cell deathRebuttalOuabainJurkat cellsVascular smooth muscleNecrosisChemistrySmooth musclePhilosophyCell biologyBiologyMedicineInternal medicineT cellBiochemistryImmunologyPolitical scienceSodiumImmune systemLaw

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We agree with the title of the counter-argument article by Florian Lang and Else Hoffmann, Cell volume changes are essential step in the cell death machinery (Lang & Hoffmann, 2013), albeit with one important proviso: this statement is true for selected rather than for all cell types and cell death stimuli. Indeed, as shown in the major section of our paper as well as in our recent review (Orlov et al. 2013), cell volume perturbations do not contribute to the triggering or progression of the cell death machinery in several types of cells, including serum-deprived vascular smooth muscle cells (VSMC) or ouabain-treated renal epithelial cells, possessing biochemical markers of apoptosis and necrosis, respectively (Orlov et al. 1999a; Platonova et al. 2011). The proapoptotic action of ouabain documented in Fas-ligand treated Jurkat cells (Panayiotidis et al. 2010) contradicts its antiapoptotic action in rat VSMC (Orlov et al. 1999b). We also would like to point out methodological limitations of several studies cited in the counter argument article. Thus, in demonstrating that pro-caspase-3 activity (Bortner et al. 1997) and DNA degradation (Ajiro et al. 2008) is inhibited by high-K+ medium, the authors did not employ high-Na+ medium as a negative control. This comment seems to be important because in vascular smooth muscle cells, the pro-caspase-3 activity is equally inhibited by elevation of [KCl] and [NaCl], thus showing that augmented ionic strength rather than elevated [Na+]i/[K+]i ratio occurring in dying cells is responsible for the effect. The death of U937 and HeLa cells documented in Cl−-depleted medium (Maeno et al. 2006) might be caused by modulation of the activity of diverse [Cl−]i-sensitive enzymes (Orlov & Hamet, 2006) rather than by inhibition of inwardly directed Na+–K+–2Cl− cotransporter NKCC1 and cell shrinkage. Indeed, to the best of our knowledge, there are no reports of cell death triggered by sustained exposure to bumetanide or other potent NKCC1 inhibitors. Readers are invited to give their views on this and the accompanying CrossTalk articles in this issue by submitting a brief comment. Comments may be posted up to 6 weeks after publication of the article, at which point the discussion will close and authors will be invited to submit a ‘final word'. To submit a comment, go to http://jp.physoc.org/letters/submit/jphysiol;591/24/6129 Please note: The publisher is not responsible for the content or functionality of any supporting information supplied by the authors. Any queries (other than missing content) should be directed to the corresponding author for the article.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,430
Score d'incertitude au seuil0,607

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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