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Enregistrement W2141831260 · doi:10.1111/j.1365-2249.2004.02513.x

Disruption of MAP kinase activation and nuclear factor binding to the IL-12 p40 promoter in HIV-infected myeloid cells

2004· article· en· W2141831260 sur OpenAlexafffund
Kelley A. Chambers, Robin J. Parks, Jonathan B. Angel

Notice bibliographique

RevueClinical & Experimental Immunology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchOntario HIV Treatment Network
Mots-clésTranscription factorBiologyp38 mitogen-activated protein kinasesPhosphorylationKinaseMolecular biologyBinding sitePromoterCytokineMyeloidMAPK/ERK pathwayCell biologyImmunologyGene expressionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Progressive immunodeficiency in HIV infection is paralleled by a decrease in IL-12 production, a cytokine crucial for cellular immune function. Here we examine the molecular mechanisms by which HIV infection suppresses IL-12 p40 expression. HIV infection of THP-1 myeloid cells resulted in decreased LPS-induced nuclear factor binding to the NF-kappaB, AP-1, and Sp1 sites of the IL-12 p40 promoter. By site-directed mutagenesis we determined that each of these sites was necessary for transcriptional activation of the IL-12 p40 promoter. Binding of NF-kappaB p50, c-Rel, p65, Sp1, Sp3, c-Fos, and c-Jun proteins to their cognate nuclear factor binding sites was somewhat impaired by HV infection, although a role for other as yet unidentified factors cannot be dismissed. The cellular levels of these transcription factors were unaffected by HIV infection, with the exception of a decrease in expression of NF-kappaB p65, consistent with the observed decrease in its binding to the IL-12 p40 promoter following HIV infection. Analysis of regulation of upstream LPS-induced MAP kinases demonstrated impaired phosphorylation of JNK and p38 MAPK, and suppressed phosphorylation and degradation of IkappaBalpha following HIV infection. These results suggest that alterations in nuclear factor binding to numerous sites in the IL-12 p40 promoter, together may contribute to the suppression in IL-12 p40 transcription previously reported. These effects on nuclear factor binding may be a direct effect of HIV infection on the IL-12 p40 promoter, or may occur indirectly as a consequence of altered MAP kinase activation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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