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Enregistrement W2141845769 · doi:10.1111/pbr.12230

Genome‐wide identification of candidate phosphate starvation responsive genes and the development of intron length polymorphism markers in maize

2014· article· en· W2141845769 sur OpenAlexaff
Chunmeng He, Hailan Liu, Shunzong Su, Yanli Lu, Bowen Luo, Zhi Nie, Ling Wu, Dan Liu, Xiao Zhang, Tingzhao Rong, Shibin Gao

Notice bibliographique

RevuePlant Breeding · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyGeneticsGeneIntronInbred strainCandidate geneGenomeGenetic marker

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract To develop genetic markers associated with tolerance to low phosphorus, we identified candidate phosphate starvation responsive ( PSR ) genes and developed their intron length polymorphism ( ILP ) markers in maize on a genome‐wide scale. Based on the known plant PSR genes, 161 candidate PSR genes were identified. Of these genes, 138 genes contained at least one intron and were then used to develop 606 PSR ‐ ILP markers by designing PCR primers to the intron‐flanking exonic regions. PCR evaluation was performed on 43 randomly selected PSR ‐ ILP markers in 30 maize inbred lines. Of the primers, 88.4% amplified stable and pure products in all maize inbred lines, and 53.5% of the markers showed ILP , with PIC values ranging from 0.06 to 0.80. The result of clustering analysis of the 30 maize inbred lines, based on the polymorphism of 23 ILP markers, suggests that the ILP markers developed in this study are not only efficient for genetic diversity analysis but also potentially useful for marker assisted selection for tolerance to low phosphorus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,887
Score d'incertitude au seuil0,121

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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