Genome‐wide identification of candidate phosphate starvation responsive genes and the development of intron length polymorphism markers in maize
Notice bibliographique
Résumé
Abstract To develop genetic markers associated with tolerance to low phosphorus, we identified candidate phosphate starvation responsive ( PSR ) genes and developed their intron length polymorphism ( ILP ) markers in maize on a genome‐wide scale. Based on the known plant PSR genes, 161 candidate PSR genes were identified. Of these genes, 138 genes contained at least one intron and were then used to develop 606 PSR ‐ ILP markers by designing PCR primers to the intron‐flanking exonic regions. PCR evaluation was performed on 43 randomly selected PSR ‐ ILP markers in 30 maize inbred lines. Of the primers, 88.4% amplified stable and pure products in all maize inbred lines, and 53.5% of the markers showed ILP , with PIC values ranging from 0.06 to 0.80. The result of clustering analysis of the 30 maize inbred lines, based on the polymorphism of 23 ILP markers, suggests that the ILP markers developed in this study are not only efficient for genetic diversity analysis but also potentially useful for marker assisted selection for tolerance to low phosphorus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».