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Enregistrement W2141882554 · doi:10.1094/pdis-91-6-0763

Letter Code System of Nomenclature for <i>Puccinia graminis</i> f. sp. <i>avenae</i>

2007· article· en· W2141882554 sur OpenAlexaff
T. G. Fetch, Yue Jin

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesSlovak Academic Information Agency
Mots-clésVirulenceBiologyStem rustPucciniaJavaGenePopulationGeneticsNomenclatureRace (biology)PhenotypeBotanyProgramming languageTaxonomy (biology)Computer scienceMildew

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Current systems that describe the virulence phenotype in Puccinia graminis f. sp. avenae lack a systematic approach for the naming of races or to provide easily made comparisons of virulence among races. A new nomenclature system that simply and systematically characterizes virulence in P. graminis f. sp. avenae is described. The new system has the distinct advantage of providing easily seen relationships among races in contrast to previous nomenclature systems. This allows for easier interpretation of virulence relationships in the oat stem rust population and provides a large amount of virulence information with a minimum of written characters. This system uses single-gene differential lines with the resistance genes Pg1, Pg2, Pg3, Pg4, Pg6, Pg8, Pg9, Pg10, Pg12, Pg13, Pg15, and Pg16, grouped into three subsets of four lines in sequential Pg gene order. By grouping in sequential gene number order, the relationship of the new system to the "standard" system is easily seen. Each race is designated by a three-letter code, based on the seedling reaction (low or high) on 12 differential lines. The letter code nomenclature system is open ended and can be updated easily as new differential genes are identified. This system simply and precisely describes the virulence phenotypes of isolates of P. graminis f. sp. avenae, and allows for easily made comparisons of virulence of isolates collected over time and across geographical locations worldwide.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,758
Score d'incertitude au seuil0,169

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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