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Enregistrement W2141919361 · doi:10.1242/jeb.02032

A potassium channel (Kv4) cloned from the heart of the tunicate<i>Ciona intestinalis</i>and its modulation by a KChIP subunit

2006· article· en· W2141919361 sur OpenAlexaff
Vicenta Salvador‐Recatalà, Warren J. Gallin, Jennifer Abbruzzese, Peter C. Ruben, Andrew N. Spencer

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensBamfield Marine Sciences CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCiona intestinalisTunicatePotassium channelProtein subunitBiologyModulation (music)Cell biologyChannel (broadcasting)BiophysicsGeneGeneticsPhysicsEcologyEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Voltage-gated ion channels of the Kv4 subfamily produce A-type currents whose properties are tuned by accessory subunits termed KChIPs, which are a family of Ca2+ sensor proteins. By modifying expression levels and the intrinsic biophysical properties of Kv4 channels, KChIPs modulate the excitability properties of neurons and myocytes. We studied how a Kv4 channel from a tunicate, the first branching clade of the chordates, is modulated by endogenous KChIP subunits. BLAST searches in the genome of Ciona intestinalis identified a single Kv4 gene and a single KChIP gene, implying that the diversification of both genes occurred during early vertebrate evolution, since the corresponding mammalian gene families are formed by several paralogues. In this study we describe the cloning and characterization of a tunicate Kv4 channel, CionaKv4, and a tunicate KChIP subunit, CionaKChIP. We demonstrate that CionaKChIP strongly modulates CionaKv4 by producing larger currents that inactivate more slowly than in the absence of the KChIP subunit. Furthermore, CionaKChIP shifted the midpoints of activation and inactivation and slowed deactivation and recovery from inactivation of CionaKv4. Modulation by CionaKChIP requires the presence of the intact N terminus of CionaKv4 because, except for a minor effect on inactivation, CionaKChIP did not modulate CionaKv4 channels that lacked amino acids 2-32. In summary, our results suggest that modulation of Kv4 channels by KChIP subunits is an ancient mechanism for modulating electrical excitability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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