Mitochondrial DNA variation in space and time in the northeastern Pacific gastropod, <i>Littorina keenae</i>
Notice bibliographique
Résumé
The present population structure of a species reflects the influence of population history as well as contemporary processes. To examine the relative importance of these factors in shaping the current population structure of Littorina keenae, we sequenced 762 base pairs of the mitochondrial ND6 and cytochrome b genes in 584 snails from 13 sites along the northeastern Pacific coast. Haplotype network analysis revealed a 'star-like' genealogy indicative of a recent population expansion. Nested clade and mismatch analyses also supported the hypothesis of sudden population expansion following a population bottleneck during the Last Glacial Maximum. Analysis of molecular variance and pairwise Phi(ST) showed no significant spatial population differentiation from Mexico to Oregon - not even across the recognized biogeographic boundary at Point Conception. This is probably due to high contemporary gene flow during the free-swimming larval stage of this snail. Surprisingly, we found a highly significant temporal population differentiation between a San Pedro sample from 1996 and one from 2005, which gave an estimate of effective population size (N(e)) of only 135. Nearly statistically significant changes in the frequency of a particular haplotype in three other populations over 2-3 years further support Hedgecock's 'sweepstakes' hypothesis. When by chance nearly all of the progeny from an aggregation of highly fecund sisters that possess a rare haplotype successfully recruit to become the next generation, the rare haplotype can become temporarily common across the entire species' range. This modification of the sweepstakes hypothesis can explain why the temporal variation that we observed was much greater than the spatial variation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».