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Enregistrement W2141938998 · doi:10.1128/iai.00369-07

Fibrotic Response as a Distinguishing Feature of Resistance and Susceptibility to Pulmonary Infection with <i>Mycobacterium tuberculosis</i> in Mice

2007· article· en· W2141938998 sur OpenAlexafffund
Jean-François Marquis, André Nantel, Ronald LaCourse, Lynn Ryan, R J North, Philippe Gros

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInterstitial Lung Diseases and Idiopathic Pulmonary Fibrosis
Établissements canadiensBiotechnology Research InstituteMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthMcGill University
Mots-clésBiologyMycobacterium tuberculosisGene expression profilingMicroarrayDNA microarrayGeneComplementary DNATuberculosisFold changeMicroarray analysis techniquesImmunologyGene expressionMolecular biologyPathologyGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The differential susceptibility of inbred mouse strains DBA/2J (susceptible) and C57BL/6J (resistant) to pulmonary tuberculosis following aerosol infection is under complex genetic control. In this report, transcriptional profiling with RNAs from Mycobacterium tuberculosis-infected lungs was used to investigate the physiological response, cell type, and biochemical pathways underlying differential susceptibility to infection. Statistical analysis of cDNA-based microarrays revealed that 1,097 transcripts showed statistically significant changes in abundance (changes of > or = 1.5-fold) in at least one of four experimental group comparisons (C57BL/6J [day 0] versus DBA/2J [day 0] mice, C57BL/6J [day 90] versus DBA/2J [day 90] mice, C57BL/6J [day 90] versus C57BL/6J [day 0] mice, or DBA/2J [day 90] versus DBA/2J [day 0] mice). A group of genes showing very high degrees of significance (changes of > or = 2.0-fold) displayed enrichment for transcripts associated with tissue remodeling and the fibrotic response. The differential expression of fibrotic response genes (Sparc, Col1a1, Col1a2, Col4a1, and Col4a2) in the infected lungs of the two mouse strains was validated by another microarray platform (Affymetrix oligonucleotide chips) and by reverse transcription-PCR. Furthermore, the differential expression of additional genes known to be associated with fibrosis (Mmp2, Timp1, and Arg1) was also validated by these approaches. Overall, these results identify the differential fibrotic response as a pathological basis for the high susceptibility of DBA/2J mice to pulmonary tuberculosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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