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Enregistrement W2141987602 · doi:10.5539/jas.v4n12p18

Chromosomal Localization of QTLs Controlling Genotype X Environment Interaction in Wheat Substitution Lines Using Nonparametric Methods

2012· article· en· W2141987602 sur OpenAlexvenueno aff
Ezatollah Farshadfar, Hooshmand Safari, Anita Yaghotipoor

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural Science · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetics and Plant Breeding
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNonparametric statisticsRank correlationStatisticsQuantitative trait locusCorrelationSpearman's rank correlation coefficientGrain yieldMathematicsBiplotTraitRandomized block designBiologyAnalysis of varianceAmmiStability (learning theory)GeneticsGenotypeGene–environment interactionGeneAgronomyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To locate the genes controlling grain yield stability, substitution line of Cheyenne (as donor) into the genetic background of Chinese Spring (as recipient) and their parents were used in a randomized complete block design with three replications under two different conditions (rain-fed and irrigated) for two years. Interrelationship among nonparametric measures showed that non-parametric statistics Si(1), Si(2), Si(3), Si(6), NPi(1), NPi(2), NPi(3), NPi(4), ?r and ?gy were significantly (P<0.01) correlated and exhibited negative and significant (P<0.01) correlation with grain yield, while the statistics RS, TOP and Kr revealed positive and significant correlation with grain yield. The results of spearman’s rank correlation were confirmed by Ward’s hierarchical cluster analysis. Principal components analysis indicated that the two first components explained 92.68% (77.71 and 14.97% by components 1 and 2, respectively) of the total variance. Screening nonparametric estimates using biplot technique based on two first components classified the stability measures in 2 groups. Nonparametric statistical procedures and ranking method indicated that most of the quantitative trait loci (QTLs) involved in controlling phenotypic stability in wheat are located on the chromosomes 2A, 3A and 4A in A genome and 3D and 5D in D genome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,824
Score d'incertitude au seuil0,128

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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