A Genomewide Linkage Scan for Abdominal Subcutaneous and Visceral Fat in Black and White Families
Notice bibliographique
Résumé
Abdominal visceral fat (AVF), abdominal subcutaneous fat (ASF), and abdominal total fat (ATF) were measured using a computed tomography scan, both before (baseline) and after (post) a 20-week endurance exercise training protocol in the HERITAGE Family Study. Each of the baseline and response (post minus baseline) measures was adjusted for several covariates, including total fat mass, and responses to training were further adjusted for baseline levels. Multipoint variance components linkage analysis using a genomewide scan of 344 markers was conducted separately by race using race-specific allele frequencies. Several promising results (P < 0.0023) were obtained. For baseline AVF, the best evidence was on 2q22.1 and 2q33.2-q36.3 (including the IRS1 locus) in whites, with suggestive findings on 7q22.2-q31.3 (including the LEP locus) in blacks. Although several regions were indicated for baseline ASF, only 4q31.22-q32.2 and 11p15.4-p11.2 replicated the results of another study. For responses to training, promising results were limited to ASF and ATF primarily on 7q36.2 (including NOS3) in blacks, with suggestive regions (P < 0.01) on 1q21.2-q24.1 (S100A, ATP1A2, and ATP1B1), 10q25.2 (ADRA2A), and 11p15.5 (IGF2). In summary, the 4q and 11p regions have now been implicated in two independent studies for ASF; further research is warranted to identify the genes and mutations in these regions that are responsible for fat accumulation in the abdominal depot. Additional work in an independent sample is needed to verify the linkages for baseline AVF as well as the response measures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».