Notice bibliographique
Résumé
Selective IgA deficiency (IgAD) is the most common primary immunodeficiency disorder in Caucasians and is defined as serum IgA concentrations below or equal to 0.07 g/l, with normal serum concentrations of IgM and IgG, in individuals 4 years of age or older. The prevalence of IgAD is approximately 1:600 in the general population and recent results have shown that patients with IgAD have significantly poorer physical health and an increased risk of early death. The domestic dog is more than just a companion and working animal. The almost 400 distinct modern dog breeds represent great phenotypical diversity and there are more than 350 naturally occurring genetic diseases in dogs which clinically resemble the corresponding human diseases. As a result of domestication, the dog’s genome is characterised by long haplotype blocks and linkage disequilibrium (LD) making the dog an appealing model for genetic studies of human diseases. Low serum IgA concentrations in dogs have been reported to clinically resemble human IgAD. However, even though the literature on IgA concentrations in dogs is extensive, the normal range of serum IgA as well as a generally accepted cut-off value for IgAD deficiency has not yet been established. We performed an extensive screen of serum IgA concentrations in more than 1,500 dogs from 22 breeds. Dog breed-specific differences in the prevalence of IgAD indicate the involvement of genetic factors in the development of the disease. Furthermore, certain dog breeds were found to stand out as high-risk breeds. Genome-wide association studies (GWAS) in selected high-risk breeds show that IgAD is associated with genes involved in B cell development and haematopoiesis. Additionally, serum IgA concentrations were found to play an important role in the aetiology of canine atopic dermatitis (CAD), an autoimmune disease in dogs. Molecular identity allowed the quantification of IgA in serum samples from Canadian and Scandinavian wolves with the same antibodies as those used in dogs. Interestingly, wolves from Scandinavia show significantly lower IgA concentrations as compared to Canadian wolves. Due to its size, the Scandinavian wolf population is prone to inbreeding and therefore, it is known to suffer from a decrease in genetic variation. Further analyses are needed to investigate whether Scandinavian wolves and dogs with a high-risk profile for IgAD share certain genetic factors List of scientific papers I. Olsson M, Frankowiack M, Tengvall K, Roosje P, Fall T, Ivansson E et al. The dog as a genetic model for immunoglobulin A (IgA) deficiency: Identification of several breeds with low serum IgA concentrations. Vet Immunol Immunopathol. 2014;255–259. https://doi.org/10.1016/j.vetimm.2014.05.010 II. Tengvall K, Kierczak M, Bergvall K, Olsson M, Frankowiack M, Farias FHG et al. Genome-wide analysis in German shepherd dogs reveals association of a locus on CFA 27 with atopic dermatitis. PLoS Genet. 2013;9:e1003475. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003475 III. Olsson M, Tengvall K, Frankowiack M, Kierczak M, Bergvall K, Axelsson E et al. Genome-wide Analyses Suggest Mechanisms Involving Early B-cell Development in Canine IgA Deficiency. [Manuscript] IV. Frankowiack M, Hellman L, Zhao Y, Arnemo JM, Lin M, Tengvall K et al. IgA deficiency in wolves. Dev Comp Immunol. 2013;40:180–184. https://doi.org/10.1016/j.dci.2013.01.005 V. Frankowiack M, Olsson M, Cluff HD, Evans AL, Hellman L, Månsson J et al. IgA deficiency in wolves from Canada and Scandinavia. Dev Comp Immunol. 2015;50:26–28. https://doi.org/10.1016/j.dci.2014.12.009
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,011 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».