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Enregistrement W2142081109 · doi:10.1111/jeu.12204

Molecular Evidence for the Polyphyly of <i>Macrotrichomonas</i> (Parabasalia: Cristamonadea) and a Proposal for <i>Macrotrichomonoides</i> n. gen.

2015· article· en· W2142081109 sur OpenAlexafffund
Gillian H. Gile, E. James, Noriko Okamoto, Kevin J. Carpenter, Rudolf H. Scheffrahn, Patrick J. Keeling

Notice bibliographique

RevueJournal of Eukaryotic Microbiology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaCanadian Institute for Advanced Research
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPolyphylyBiologyFlagellateGenusCladeFlagellumZoologyEvolutionary biologyPhylogeneticsBotanyPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Macrotrichomonas (Cristamonadea: Parabasalia) is an anaerobic, amitochondriate flagellate symbiont of termite hindguts. It is noteworthy for being large but not structurally complex compared with other large parabasalians, and for retaining a structure similar in appearance to the undulating membrane (UM) of small flagellates closely related to cristamonads, e.g. Tritrichomonas. Here, we have characterised the SSU rDNA from two species described as Macrotrichomonas: M. restis Kirby 1942 from Neotermes jouteli and M. lighti Connell 1932 from Paraneotermes simplicicornis. These species do not form a clade: M. lighti branches with previously characterised Macrotrichomonas sequences from Glyptotermes, while M. restis branches with the genus Metadevescovina. We examined the M. restis UM by light microscopy, scanning electron microscopy, and transmission electron microscopy, and we find common characteristics with the proximal portion of the robust recurrent flagellum of devescovinids. Altogether, we show the genus Macrotrichomonas to be polyphyletic and propose transferring M. restis to a new genus, Macrotrichomonoides. We also hypothesise that the macrotrichomonad body plan represents the ancestral state of cristamonads, from which other major forms evolved.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,461
Score d'incertitude au seuil0,238

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,095
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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