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Enregistrement W2142133732 · doi:10.1093/hmg/ddv097

Contribution of common non-synonymous variants in PCSK1 to body mass index variation and risk of obesity: a systematic review and meta-analysis with evidence from up to 331 175 individuals

2015· review· en· W2142133732 sur OpenAlexafffund
Kevin T. Nead, Ang Li, Mackenzie R. Wehner, Binod Neupane, Stefan Gustafsson, Adam S. Butterworth, James C. Engert, April Davis, Robert A. Hegele, Ruby Miller, Marcel den Hoed, K.-T. Khaw, Tuomas O. Kilpeläinen, Nicholas J. Wareham, Todd L. Edwards, G. Hallmans, Tibor V. Varga, Sharon L. R. Kardia, Jennifer A. Smith, Wei Zhao, Jessica D. Faul, David R. Weir, Jia Mi, Bo Xi, Andrés Sebastián Quinteros, Cyrus Cooper, Avan Aihie Sayer, Anthony James, Anders Grøntved, M. Fornage, Stephen Sidney, Craig L. Hanis, Heather M. Highland, Hans‐Ulrich Häring, Martin Heni, Jessica Lasky‐Su, Scott T. Weiss, Glenn S. Gerhard, C D Still, M Mĕlka, Zdenka Pausová, T. Paus, Struan F.A. Grant, Håkon Håkonarson, R. Arlen Price, Kai Wang, André Scherag, Johannes Hebebrand, Anke Hinney, Paul W. Franks, Timothy M. Frayling, Mark I. McCarthy, Joel N. Hirschhorn, Ruth J. F. Loos, E. Ingelsson, Hertzel C. Gerstein, Salim Yusuf, Joseph Beyene, Sonia S. Anand, Stephen Eyre

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2015
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenWestern UniversityMcGill University Health CentreSickKids FoundationUniversity of TorontoHamilton Health SciencesHamilton General HospitalPopulation Health Research InstituteMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteRIKENMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyNational Institute on AgingGates Cambridge TrustCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchMedical Research CouncilCambridge TrustBritish Heart FoundationCancer Research UK
Mots-clésBiologyMeta-analysisObesityVariation (astronomy)Body mass indexGeneticsGenetic variationEvolutionary biologyBioinformaticsGeneInternal medicineEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polymorphisms rs6232 and rs6234/rs6235 in PCSK1 have been associated with extreme obesity [e.g. body mass index (BMI) ≥ 40 kg/m(2)], but their contribution to common obesity (BMI ≥ 30 kg/m(2)) and BMI variation in a multi-ethnic context is unclear. To fill this gap, we collected phenotypic and genetic data in up to 331 175 individuals from diverse ethnic groups. This process involved a systematic review of the literature in PubMed, Web of Science, Embase and the NIH GWAS catalog complemented by data extraction from pre-existing GWAS or custom-arrays in consortia and single studies. We employed recently developed global meta-analytic random-effects methods to calculate summary odds ratios (OR) and 95% confidence intervals (CIs) or beta estimates and standard errors (SE) for the obesity status and BMI analyses, respectively. Significant associations were found with binary obesity status for rs6232 (OR = 1.15, 95% CI 1.06-1.24, P = 6.08 × 10(-6)) and rs6234/rs6235 (OR = 1.07, 95% CI 1.04-1.10, P = 3.00 × 10(-7)). Similarly, significant associations were found with continuous BMI for rs6232 (β = 0.03, 95% CI 0.00-0.07; P = 0.047) and rs6234/rs6235 (β = 0.02, 95% CI 0.00-0.03; P = 5.57 × 10(-4)). Ethnicity, age and study ascertainment significantly modulated the association of PCSK1 polymorphisms with obesity. In summary, we demonstrate evidence that common gene variation in PCSK1 contributes to BMI variation and susceptibility to common obesity in the largest known meta-analysis published to date in genetic epidemiology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,026
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,055

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,026
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0150,025
Bibliométrie0,0080,011
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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