MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2142303444 · doi:10.1242/dev.01715

Imprinted X-inactivation in extra-embryonic endoderm cell lines from mouse blastocysts

2005· article· en· W2142303444 sur OpenAlexaff
Tilo Kunath, Danielle Arnaud, Gary D. Uy, Ikuhiro Okamoto, Corinne Chureau, Yojiro Yamanaka, Édith Heard, Richard L. Gardner, Philip Avner, Janet Rossant

Notice bibliographique

RevueDevelopment · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpiblastEndodermBiologyEmbryonic stem cellBlastocystInner cell massCell biologyTrophoblastChimera (genetics)EmbryoGeneticsEmbryogenesisPlacentaGastrulationGeneFetus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The extra-embryonic endoderm lineage plays a major role in the nutritive support of the embryo and is required for several inductive events, such as anterior patterning and blood island formation. Blastocyst-derived embryonic stem (ES) and trophoblast stem (TS) cell lines provide good models with which to study the development of the epiblast and trophoblast lineages, respectively. We describe the derivation and characterization of cell lines that are representative of the third lineage of the blastocyst -extra-embryonic endoderm. Extra-embryonic endoderm (XEN) cell lines can be reproducibly derived from mouse blastocysts and passaged without any evidence of senescence. XEN cells express markers typical of extra-embryonic endoderm derivatives, but not those of the epiblast or trophoblast. Chimeras generated by injection of XEN cells into blastocysts showed exclusive contribution to extra-embryonic endoderm cell types. We used female XEN cells to investigate the mechanism of X chromosome inactivation in this lineage. We observed paternally imprinted X-inactivation, consistent with observations in vivo. Based on gene expression analysis, chimera studies and imprinted X-inactivation, XEN cell lines are representative of extra-embryonic endoderm and provide a new cell culture model of an early mammalian lineage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations406
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueDevelopmentMême sujetPluripotent Stem Cells ResearchTravaux en français237 207