Notice bibliographique
Résumé
The first complete mechanistic analysis of halide ion oxidation by a peroxidase was that of iodide oxidation by horseradish peroxidase. It was shown conclusively that a two-electron oxidation of iodide by compound I was occurring. This implied that oxygen atom transfer was occurring from compound I to iodide, forming hypoiodous acid, HOI. Searches were conducted for other two-electron oxidations. It was found that sulfite was oxidized by a two-electron mechanism. Nitrite and sulfoxides were not. If a competing substrate reduces some compound I to compound II by the usual one-electron route, then compound II will compete for available halide. Thus compound II oxidizes iodide to an iodine atom, I*, although at a slower rate than oxidation of I by compound I. An early hint that mammalian peroxidases were designed for halide ion oxidation was obtained in the reaction of lactoperoxidase compound II with iodide. The reaction was accelerated by excess iodide, indicating a co-operative effect. Among the heme peroxidases, only chloroperoxidase (for example from Caldariomyces fumago) and mammalian myeloperoxidase are able to oxidize chloride ion. There is not yet a consensus as to whether the chlorinating agent produced in a peroxidase-catalyzed reaction is hypochlorous acid (HOCl), enzyme-bound hypochlorous acid (either Fe-HOCl or X-HOCl where X is an amino acid residue), or molecular chlorine Cl2. A study of the nonenzymatic iodination of tyrosine showed that the iodinating reagent was either HOI or I2. It was impossible to tell which species because of the equilibria: [reaction: see text] The same considerations apply to product analysis of an enzyme-catalyzed reaction. Detection of molecular chlorine Cl2 does not prove it is the chlorinating species. If Cl2 is in equilibrium with HOCl then one cannot tell which (if either) is the chlorinating reagent. Examples will be shown of evidence that peroxidase-bound hypochlorous acid is the chlorinating agent. Also a recent clarification of the mechanism of reaction of myeloperoxidase with hydrogen peroxide and chloride along with accurate determination of the elementary rate constants will be discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».