The first doubled haploid linkage map for cultivated oat
Notice bibliographique
Résumé
To date, all linkage maps of hexaploid oat (Avena sativa L.) have been constructed using recombinant inbred lines (RILs). Doubled haploids (DHs), however, have the advantage over RILs of their comprehensive homozygosity. DHs have been used for mapping in several cereal species, but in oats the production of large DH populations has only recently become an option. A linkage map of hexaploid oat was constructed using an anther culture-derived DH population (137 individuals) from the F1 individuals of a cross between the Finnish cultivar 'Aslak' and the Swedish cultivar 'Matilda'. The map is composed of 28 linkage groups containing 625 DNA markers: 375 AFLPs (amplified fragment length polymorphisms), 3 IRAPs (inter-retrotransposon amplified polymorphisms), 12 ISSRs (inter simple sequence repeats), 12 microsatellites, 57 RAPDs (random amplified polymorphic DNAs), 59 REMAPs (retrotransposon-microsatellite amplified polymorphisms), 105 SRAPs (sequence-related amplified polymorphisms), and 2 SNPs (single-nucleotide polymorphisms). The total map size is 1526 cM. Over half of the markers in the map showed distorted segregation, with alleles from 'Aslak' usually prevailing. This is explained by the better performance of 'Aslak' in anther culture. Quantitative trait loci affecting some important quality and agronomic traits are being localized on the map.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».