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Enregistrement W2142360508 · doi:10.1136/archdischild-2013-304484

Velopharyngeal insufficiency: high detection rate of genetic abnormalities if associated with additional features

2013· article· en· W2142360508 sur OpenAlexaff
Charlotte W. Ockeloen, Jill Simpson, Jill Urquhart, Julie Davies, M. Bowden, Kelly Patrick, Joël Doré, Jill Clayton‐Smith

Notice bibliographique

RevueArchives of Disease in Childhood · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCleft Lip and Palate Research
Établissements canadiensHealth Sciences Centre
Organismes subventionnairesHealing Foundation
Mots-clésMedicineVelopharyngeal insufficiencyIn situ hybridisationComparative genomic hybridizationChromosomeAbnormalityClinical significanceSpeech delayPopulationPediatricsMedical geneticsPathologyGeneticsSurgeryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To review the clinical and molecular-genetic characteristics of 34 children who were referred to the clinical genetics department with a presenting diagnosis of definite or suspected velopharyngeal insufficiency (VPI, defined as the inability to close off the nasal from the oral cavity during speech) or hyponasal/hypernasal speech. All the patients referred also had additional anomalies and did not therefore comprise the whole VPI population. METHODS: Patients were clinically investigated by a clinical geneticist. Fluorescent in situ hybridisation for chromosome 22q11 deletion and/or array comparative genomic hybridisation (array CGH) analysis was performed in all cases. A literature review was performed using the Pubmed online database. RESULTS: Microdeletions or microduplications were identified in half of the patients. Six patients (∼18% of total) carried a chromosome 22q11 microdeletion, one patient had a chromosome 22q11 microduplication, and four patients had microdeletions in other chromosomes that were considered likely to be associated with the phenotype. One patient had KBG syndrome. Thus, an underlying genetic abnormality was found in approximately one-third (35%) of our patients. An additional seven patients harboured copy number variations that were considered benign or of unknown significance. CONCLUSIONS: We present an overview of patients with VPI or hyponasal/hypernasal speech with additional anomalies and their clinical and genetic findings. In one-third of these patients, an underlying genetic abnormality was identified. This has important implications for family counselling and medical follow-up. Furthermore, we recommend array CGH testing in all patients with VPI and associated anomalies because of the high percentage of copy number variants identified in these patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,246
Score d'incertitude au seuil0,402

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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