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Enregistrement W2142424488 · doi:10.1128/jb.01957-14

The Vibrio cholerae Cpx Envelope Stress Response Senses and Mediates Adaptation to Low Iron

2014· article· en· W2142424488 sur OpenAlexafffund
Nicole Acosta, Stefan Pukatzki, Tracy Raivio

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésRegulonVibrio choleraeBiologyCell envelopeHistidine kinaseEffluxResponse regulatorBacterial outer membraneEl TorOperonCell biologyMicrobiologyGeneticsGeneRegulation of gene expressionMutantEscherichia coliBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Cpx pathway, a two-component system that employs the sensor histidine kinase CpxA and the response regulator CpxR, regulates crucial envelope stress responses across bacterial species and affects antibiotic resistance. To characterize the CpxR regulon in Vibrio cholerae, the transcriptional profile of the pandemic V. cholerae El Tor C6706 strain was examined upon overexpression of cpxR. Our data show that the Cpx regulon of V. cholerae is enriched in genes encoding membrane-localized and transport proteins, including a large number of genes known or predicted to be iron regulated. Activation of the Cpx pathway further led to the expression of TolC, the major outer membrane pore, and of components of two RND efflux systems in V. cholerae. We show that iron chelation, toxic compounds, or deletion of specific RND efflux components leads to Cpx pathway activation. Furthermore, mutations that eliminate the Cpx response or members of its regulon result in growth phenotypes in the presence of these inducers that, together with Cpx pathway activation, are partially suppressed by iron. Cumulatively, our results suggest that a major function of the Cpx response in V. cholerae is to mediate adaptation to envelope perturbations caused by toxic compounds and the depletion of iron.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,839
Score d'incertitude au seuil0,347

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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