MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2142433684 · doi:10.1002/ajmg.a.32255

Interstitial deletion of 1p22.2p31.1 and medium‐chain acyl‐CoA dehydrogenase deficiency in a patient with global developmental delay

2008· review· en· W2142433684 sur OpenAlexaff
Gustavo Maegawa, Nicola K. Poplawski, Brage Storstein Andresen, S. E. Olpin, Gloria Nie, Joe T.R. Clarke, Ikuko Teshima

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2008
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensHôpital FleurimontCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMissense mutationExonBreakpointGlobal developmental delayBiologyGeneticsMutationPsychomotor retardationCompound heterozygosityComparative genomic hybridizationInternal medicineEndocrinologyMolecular biologyPhenotypeGeneChromosomeMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report on a 6-year-old girl who presented at 6 months of age with seizures, delayed psychomotor development and mild facial dysmorphism. A small muscular ventricular septal defect was documented on echocardiogram and brain MRI showed a frontal brain anomaly. Urine organic acid analysis revealed dicarboxylic aciduria, and plasma acylcarnitine analysis showed marked elevation of octanoyl (C8) and decanoyl (C10) carnitines with C8:C10 ratio of 9:1. These results were indicative of medium chain acyl-CoA dehydrogenase deficiency. ACADM gene sequencing showed an apparent homozygous c.166G > C (Ala31Pro) missense mutation in exon 3; however, only the mother was found to be a carrier of this novel missense mutation. This finding along with non-regressive developmental delay prompted further karyotype and genomic investigations. An interstitial deletion of chromosome 1 was detected by repeat G-banding: 46,XX,del(1)(p22.2p31.1). Parental karyotypes were normal. The deletion was characterized by array CGH analysis using a 1 Mb BAC/PAC array platform. Clones deleted extended from RP11-88B10 (1p31.1) to RP5-1007M22 (1p22.2), a 15.5 Mb deletion which includes the ACADM locus. Clinical review of 6/7 cases of interstitial deletions with breakpoints of 1p22 and 1p31/32, including the patient in this report, indicate a variable phenotype. Thus, although G-band breakpoints are similar, common breakpoints for these alterations are unlikely. This is the first report of a patient with fatty acid oxidation defect caused by a mutation in combination with an interstitial chromosomal deletion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAmerican Journal of Medical Genetics Part AMême sujetMetabolism and Genetic DisordersTravaux en français237 207