Microarray Analysis Identifies Pathways In Progression of Early Stage Lung Adenocarcinoma: The Importance of Focal Adhesion and ECM-Receptor Interactions
Notice bibliographique
Résumé
Recurrence after lung cancer surgery is high, even among Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC) adenocarcinoma patients diagnosed early as Stage I, where there has been no spread to lymph nodes.Understanding the biological underpinnings of aggressivity and recurrence in this subset of tumours may enable the identiication of patients who would beneit from adjuvant therapy.The purpose of this study was to identify differentially expressed molecular biomarkers that might underlie recurrence of Stage I tumours by comparing gene expression in later-stage tumours with those expressed in early-stage tumours.Gene expression in tissue biopsy samples from ive Stage I and ive Stage II/III NSCLC adenocarcinoma patients was analysed using an oligonucleotide microarray containing 17,000 probes printed in duplicate.Analyses were performed on total RNA isolated from tumour tissue of each patient using universal human RNA as a reference.Compared to normal tissues, the transcriptome of Stage I NSCLC adenocarcinomas showed enrichment in general pathways in cancer, whereas in Stage II/III more speciic cancer pathways such as focal adhesion and ECM-receptor interaction pathways were enriched and components of the PPAR signalling pathway were depleted.Relative to early-stage NSCLC, Stage II/III adenocarcinomas showed up-regulation of genes of the basic transcriptional and translational machinery, particularly the "cancer testis antigen" PASD1 transcription factor.The actin cytoskeleton re-organisation and interleukin-6 pathways were also up-regulated whereas there was a generalized down-regulation of immune effectors and genes involved in immune system development.This small-scale transcriptome study provides important information about the pathways and molecules likely to be involved in the more metastatic propensity of those Stage I NSCLC adenocarcinomas that recur.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».