MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2142469087 · doi:10.1002/pro.628

T‐shaped arrangement of the recombinant agrin G3 – IgG Fc protein

2011· article· en· W2142469087 sur OpenAlex
Trushar R. Patel, Markus Meier, Jianhua Li, Gordon A. Morris, Arthur J. Rowe, Jörg Stetefeld

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueProtein Science · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchManitoba Health Research Council
Mots-clésAgrinSmall-angle X-ray scatteringChemistryFusion proteinDystroglycanRecombinant DNABiophysicsCrystallographyScatteringExtracellular matrixAcetylcholine receptorReceptorBiochemistryPhysicsBiologyLamininOpticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Agrin is a large heparin sulphate proteoglycan with multiple domains, which is located in the extracellular matrix. The C-terminal G3 domain of agrin is functionally one of the most important domains. It harbors an α-dystroglycan binding site and carries out acetylcholine receptor clustering activities. In the present study, we have fused the G3 domain of agrin to an IgG Fc domain to produce a G3-Fc fusion protein that we intend to use as a tool to investigate new binding partners of agrin. As a first step of the study, we have characterized the recombinant fusion protein using a multidisciplinary approach using dynamic light scattering, analytical ultracentrifugation and small angle X-ray scattering (SAXS). Interestingly, our SAXS analysis using the high-resolution structures of G3 and Fc domain as models indicates that the G3-Fc protein forms a T-shaped molecule with the G3 domains extruding perpendicularly from the Fc scaffold. To validate our models, we have used the program HYDROPRO to calculate the hydrodynamic properties of the solution models. The calculated values are in excellent agreement with those determined experimentally.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,310

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle