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Enregistrement W2142508159 · doi:10.1186/1478-811x-12-31

Internal translation of the connexin 43 transcript

2014· article· en· W2142508159 sur OpenAlexfundno aff
Clàudia Salat-Canela, Marta Sesé, Cristina Peula, Santiago Ramón y Cajal, Trond Aasen

Notice bibliographique

RevueCell Communication and Signaling · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEuropean Regional Development FundInstituto de Salud Carlos IIIMcGill University
Mots-clésInternal ribosome entry siteTranslation (biology)PI3K/AKT/mTOR pathwayGene isoformBiologyFive prime untranslated regionConnexinEukaryotic translationMessenger RNACell biologyTranslational regulationGeneSignal transductionGeneticsGap junction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Connexin 43 (Cx43), the most widely expressed gap junction protein, is associated with a number of physiological and pathological conditions. Many functions of Cx43 have been shown to be independent of gap junction formation and only require the expression of Cx43 C-terminal fragments. Recent evidence demonstrated that naturally occurring C-terminal isoforms can be generated via internal translation. FINDINGS: Here, we confirm that C-terminal domains of Cx43, particularly the major 20-kDa isoform, can be independently generated and regulated by internal translation of the same single GJA1 gene transcript that encodes full-length Cx43. Through direct RNA transfection experiments, we provide evidence that internal translation is not due to a bona fide cap-independent IRES-mediated mechanism, as upstream ribosomal scanning or translation is required. In addition to the mTOR pathway, we show for the first time, using both inhibitors and cells from knockout mice, that the Mnk1/2 pathway regulates the translation of the main 20-kDa isoform. CONCLUSIONS: Internal translation of the Cx43 transcript occurs but is not cap-independent and requires translation upstream of the internal start codon. In addition to the PI3K/AKT/mTOR pathway, the major 20-kDa isoform is regulated by the Mnk1/2 pathway. Our results have major implications for past and future studies describing gap junction-independent functions of Cx43 in cancer and other pathological conditions. This study provides further clues to the signalling pathways that regulate internal mRNA translation, an emerging mechanism that allows for increased protein diversity and functional complexity from a single mRNA transcript.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations85
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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