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Enregistrement W2142527685 · doi:10.1086/430349

Mechanisms Underlying<i>Campylobacter fetus</i>Pathogenesis in Humans: Surface‐Layer Protein Variation in Relapsing Infections

2005· article· en· W2142527685 sur OpenAlexaff
Zhengchao Tu, Christiane Gaudreau, Martin J. Blaser

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensHôpital Saint-LucCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésBiologyAntigenic variationCampylobacter fetusFetusPhenotypeVirulencePhase variationAntigenLocus (genetics)CampylobacterGeneticsPathogenesisGeneImmunologyBacteriaPregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Campylobacter fetus causes gastrointestinal and systemic infections in humans. Although relapse is common despite antibiotic treatment, the mechanisms are not well understood. The surface-layer proteins (SLPs) of C. fetus, which are critical in virulence, undergo high-frequency phenotypic switching due to recombination of sap homologues, resulting in antigenic variation. To investigate the mechanisms involved in relapsing C. fetus infections, we compared SLP variation in 4 pairs of C. fetus strains that infect humans; initial and follow-up isolations were performed 20 days to 34 months apart. Of the 4 pairs of strains, 2 had antigenic variation, and another provided evidence for selection for SLP-positive populations. Southern hybridization indicated recombination underlying the SLP variation and up-regulation. The fourth pair had the same SLP antigenic profile and sap homologue hybridization pattern, which is consistent with latency of the original strain in a privileged locus. In total, these findings indicate that relapse may reflect at least 3 differing pathogenetic pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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