Effects of the invasive plant garlic mustard (<i>Alliaria petiolata</i>) on bacterial communities in a northern hardwood forest soil
Notice bibliographique
Résumé
We compared the effects of the invasive plant Alliaria petiolata (garlic mustard) and 2 native plants on soil bacterial communities in a mature mesophytic forest. Soil samples were collected from plant patches containing either Alliaria or the native plants Allium tricoccum (wild leek) and Gallium triflorum (bedstraw). Since Alliaria litter contains secondary compounds that have reported antimicrobial properties, soil was collected outside the root zone of the plants but within the plant patches such that the soil would have been influenced by the litter of the respective plant species but not by plant roots. DNA was extracted from the soil samples and used to amplify the 16S rRNA gene region using bacterial specific primers. Terminal restriction fragment length polymorphism (TRFLP) profiles of each bacterial community were used to examine differences in bacterial communities among the plant species and between August and April sampling. Bacterial richness, evenness, and diversity were not significantly affected by plant species. Non-metric multidimensional scaling (NMS) suggested that differences existed between August and April sampling, but that plant species litter exerted a much weaker effect on soil bacterial communities. Soil physiochemical conditions were significantly correlated with soil bacterial communities and may underlie the observed seasonal changes in bacterial communities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».