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Enregistrement W2142660127 · doi:10.1094/phyto-97-7-0825

Characterization and Distribution of Mating Type Genes in the Dothistroma Needle Blight Pathogens

2007· article· en· W2142660127 sur OpenAlexaboutno aff
Marizeth Groenewald, Irene Barnes, Rosie E. Bradshaw, A. V. Brown, Angie Dale, J.Z. Groenewald, Kathy J. Lewis, Brenda D. Wingfield, Michael J. Wingfield, P.W. Crous

Notice bibliographique

RevuePhytopathology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesKoninklijke Nederlandse Akademie van Wetenschappen
Mots-clésBiologyMating typeBlightGeneType (biology)MatingDistribution (mathematics)GeneticsBotanyMicrobiologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Dothistroma septosporum and D. pini are the two causal agents of Dothistroma needle blight of Pinus spp. in natural forests and plantations. Degenerate primers amplified portions of mating type genes (MAT1-1-1 and MAT1-2) and chromosome walking was applied to obtain the full-length genes in both species. The mating-type-specific primers designed in this study could distinguish between the morphologically similar D. pini and D. septosporum and between the different mating types of these species. Screening of isolates from global collections of D. septosporum showed that only MAT2 isolates are present in Australian and New Zealand collections, where only the asexual form of the fungus has been found. In contrast, both mating types of D. septosporum were present in collections from Canada and Europe, where the sexual state is known. Intriguingly, collections from South Africa and the United Kingdom, where the sexual state of the fungus is unknown, included both mating types. In D. pini, for which no teleomorph is known, both mating types were present in collections from the United States. These results provided new insights into the biology and global distribution of two of the world's most important pine pathogens and should facilitate management of the diseases caused by these fungi.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations91
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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