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Enregistrement W2142832641 · doi:10.4319/lom.2009.7.269

Expressing biomarker data in stoichiometric terms: shifts in distribution and biogeochemical interpretation

2009· article· en· W2142832641 sur OpenAlexafffund
Robert J. Panetta, Yves Gélinas

Notice bibliographique

RevueLimnology and Oceanography Methods · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueHydrocarbon exploration and reservoir analysis
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesFonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les Technologies
Mots-clésBiomarkerComparabilityInterpretation (philosophy)Consistency (knowledge bases)Multivariate statisticsEnvironmental chemistryChemistryStatisticsComputer scienceMathematicsArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Quantitative biomarker analysis is an invaluable tool used routinely by organic geochemists to interpret and explain environmental processes. Since the advent of organic geochemistry, all levels of biomarker methodology from wet chemistry to data interpretation have significantly advanced; however, an important aspect of data analysis has remained constant and that is the expression of biomarkers in terms of mass (e.g., mg gOC −1 ). We argue that biomarkers are more appropriately expressed in terms of moles (e.g., mmol molOC −1 ) to better reflect molecular‐level distribution of compounds of interest, as well as introducing a chemical consistency for better comparability and transferability between data sets. Using modeled and real data culled from the literature, we demonstrate that the use of moles is not a trivial conversion and that distribution and relative weighting of biomarker data sets are shifted and affect the total data structure. The shift is sometimes strong enough to exert changes in interpretation (e.g., microbial abundance in an estuarine system), alter proxies (e.g., terrestrial‐to‐aquatic ratio), and potentially influence the use of multivariate statistical methods (e.g., principal components analysis).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,617
Score d'incertitude au seuil0,464

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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