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Enregistrement W2142877995 · doi:10.1128/mcb.23.8.3013-3028.2003

CDP/Cux Stimulates Transcription from the DNA Polymerase α Gene Promoter

2003· article· en· W2142877995 sur OpenAlexaff
Mary Truscott, Lelia C. Raynal, Peter David Premdas, Brigitte Goulet, Lam Leduy, Ginette Bérubé, Alain Nepveu

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMolecular biologyRepressorDNA replicationPromoterChromatin immunoprecipitationTranscriptional regulationTranscription (linguistics)ChromatinDNA polymeraseDNAGene expressionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CDP/Cux (CCAAT-displacement protein/cut homeobox) contains four DNA binding domains, namely, three Cut repeats (CR1, CR2, and CR3) and a Cut homeodomain. CCAAT-displacement activity involves rapid but transient interaction with DNA. More stable DNA binding activity is up-regulated at the G(1)/S transition and was previously shown to involve an N-terminally truncated isoform, CDP/Cux p110, that is generated by proteolytic processing. CDP/Cux has been previously characterized as a transcriptional repressor. However, here we show that expression of reporter plasmids containing promoter sequences from the human DNA polymerase alpha (pol alpha), CAD, and cyclin A genes is stimulated in cotransfections with N-terminally truncated CDP/Cux proteins but not with full-length CDP/Cux. Moreover, expression of the endogenous DNA pol alpha gene was stimulated following the infection of cells with a retrovirus expressing a truncated CDP/Cux protein. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) assays revealed that CDP/Cux was associated with the DNA pol alpha gene promoter specifically in the S phase. Using linker scanning analyses, in vitro DNA binding, and ChIP assays, we established a correlation between binding of CDP/Cux to the DNA pol alpha promoter and the stimulation of gene expression. Although we cannot exclude the possibility that stimulation of gene expression by CDP/Cux involved the repression of a repressor, our data support the notion that CDP/Cux participates in transcriptional activation. Notwithstanding its mechanism of action, these results establish CDP/Cux as an important transcriptional regulator in the S phase.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,685

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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