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Enregistrement W2142929373 · doi:10.1136/jmg.2008.063818

Clinical spectrum of <i>SIX3</i>-associated mutations in holoprosencephaly: correlation between genotype, phenotype and function

2009· article· en· W2142929373 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensMount Sinai HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNHLBI Division of Intramural ResearchNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésHoloprosencephalyPenetranceGeneticsBiologyZebrafishProbandPhenotypeMutationGenetic testingGeneSonic hedgehog

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Holoprosencephaly (HPE) is the most common structural malformation of the human forebrain. There are several important HPE mutational target genes, including the transcription factor SIX3, which encodes an early regulator of Shh, Wnt, Bmp and Nodal signalling expressed in the developing forebrain and eyes of all vertebrates. OBJECTIVE: To characterise genetic and clinical findings in patients with SIX3 mutations. METHODS: Patients with HPE and their family members were tested for mutations in HPE-associated genes and the genetic and clinical findings, including those for additional cases found in the literature, were analysed. The results were correlated with a mutation-specific functional assay in zebrafish. RESULTS: In a cohort of patients (n = 800) with HPE, SIX3 mutations were found in 4.7% of probands and additional cases were found through testing of relatives. In total, 138 cases of HPE were identified, 59 of whom had not previously been clinically presented. Mutations in SIX3 result in more severe HPE than in other cases of non-chromosomal, non-syndromic HPE. An over-representation of severe HPE was found in patients whose mutations confer greater loss of function, as measured by the functional zebrafish assay. The gender ratio in this combined set of patients was 1.5:1 (F:M) and maternal inheritance was almost twice as common as paternal. About 14% of SIX3 mutations in probands occur de novo. There is a wide intrafamilial clinical range of features and classical penetrance is estimated to be at least 62%. CONCLUSIONS: Our data suggest that SIX3 mutations result in relatively severe HPE and that there is a genotype-phenotype correlation, as shown by functional studies using animal models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,116
Score d'incertitude au seuil0,325

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle