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Enregistrement W2143276862 · doi:10.1002/glia.20645

Prolyl endopeptidase is revealed following SILAC analysis to be a novel mediator of human microglial and THP‐1 cell neurotoxicity

2008· article· en· W2143276862 sur OpenAlexaff
Andis Klegeris, Jane Li, Theo K. Bammler, Jinghua Jin, David C. Zhu, Daniel T. Kashima, Sheng Pan, Sadayuki Hashioka, John A. Maguire, Patrick L. McGeer, Jing Zhang

Notice bibliographique

RevueGlia · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeptidase Inhibition and Analysis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute on Aging
Mots-clésStable isotope labeling by amino acids in cell cultureNeurotoxicityMicrogliaBiologyCell cultureProlyl endopeptidaseNeuroinflammationArginineMolecular biologyBiochemistryAmino acidChemistryInflammationProteomicsImmunologyEnzymeToxicity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Reactive microglial cells may exacerbate the pathology in some neurodegenerative disorders. Supernatants of stimulated human microglial cells, or their surrogate THP-1 cells, are lethal to cultured human neuroblastoma SH-SY5Y cells. To explore this neurotoxicity, we examined the spectrum of proteins generated by THP-1 cells using the technique of stable isotope labeling by amino acids in cell culture (SILAC). Unstimulated cells were grown in medium with light L-[(12)C(6)] arginine while cells stimulated by lipopolysaccharide (LPS) plus interferon-gamma (IFN-gamma) were grown in medium with heavy L-[(13)C(6)] arginine. Proteins isolated from the media were digested with trypsin, and relative concentrations of generated peptides determined by mass spectrometry. More than 1,500 proteins or putative proteins were identified. Of these, 174 were increased and 189 decreased by more than twofold in the stimulated cell supernatant. We selected one upregulated protein, prolyl endopeptidase (PEP), for further investigation of its potential contribution to neurotoxicity. We first confirmed its upregulation by comparing its enzymatic activity in stimulated and unstimulated cell supernatants. We then evaluated two specific PEP inhibitors, Boc-Asn-Phe-Pro-aldehyde and Z-Pro-Pro-aldehyde-dimethyl acetal, for their potential to reduce toxicity of stimulated THP-1 cell and human microglia supernatants towards SH-SY5Y cells. We found both to be partially protective in a concentration-dependent manner. Inhibition of PEP may be a therapeutic approach to neurodegenerative disorders including Alzheimer and Parkinson diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,772

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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