Accuracy of polymerase chain reaction assays for diagnosis of feline immunodeficiency virus infection in cats
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To determine the sensitivity, specificity, and overall diagnostic accuracy of polymerase chain reaction (PCR) assays offered by commercial diagnostic laboratories for diagnosis of FIV infection in cats. DESIGN: Prospective clinical trial. ANIMALS: 124 cats. PROCEDURE: Blood was collected from cats that were neither infected with nor vaccinated against FIV, uninfected cats that were vaccinated with a licensed FIV vaccine, and cats experimentally and naturally infected with FIV representing subtypes A, B, and C. Coded blood samples were submitted to 3 laboratories in the United States and Canada offering PCR assays for diagnosis of FIV infection to veterinary practitioners. All laboratories tested fresh blood samples, and 1 laboratory also tested samples submitted as dried blood smears. The FIV infection status in all cats was confirmed by virus isolation. Sensitivity, specificity, and correct results were calculated for each PCR assay. RESULTS: Sensitivity ranged from 41% to 93%. Specificity ranged from 81% to 100% in unvaccinated cats and 44% to 95% in cats vaccinated against FIV. Correct results were obtained in 58% to 90% of 124 cats tested. All tests misidentified both uninfected and infected cats. False-positive results by all laboratories were higher in cats vaccinated against FIV than in unvaccinated cats, suggesting that vaccination interferes with the performance or interpretation of PCR assays used for diagnosis of FIV infection. CONCLUSIONS AND CLINICAL RELEVANCE: PCR assays used for diagnosis of FIV infection presently marketed to veterinary practitioners in North America vary significantly in diagnostic accuracy and did not resolve the diagnostic dilemma resulting from vaccination of cats against FIV.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,014 | 0,050 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».