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Enregistrement W2143432207 · doi:10.1083/jcb.153.7.1465

Nup2p Dynamically Associates with the Distal Regions of the Yeast Nuclear Pore Complex

2001· article· en· W2143432207 sur OpenAlexaff
David J. Dilworth, Adisetyantari Suprapto, Júlio C. Padovan, Brian T. Chait, Richard W. Wozniak, Michael P. Rout, John D. Aitchison

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Cell Biology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Center for Research Resources
Mots-clésNucleoporinNuclear poreNucleoplasmRanNuclear transportCytoplasmCell biologyCompartment (ship)GTP'NucleusChemistryBiologyCell nucleusBiophysicsBiochemistryNucleolus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nucleocytoplasmic transport is mediated by the interplay between soluble transport factors and nucleoporins resident within the nuclear pore complex (NPC). Understanding this process demands knowledge of components of both the soluble and stationary phases and the interface between them. Here, we provide evidence that Nup2p, previously considered to be a typical yeast nucleoporin that binds import- and export-bound karyopherins, dynamically associates with the NPC in a Ran-facilitated manner. When bound to the NPC, Nup2p associates with regions corresponding to the nuclear basket and cytoplasmic fibrils. On the nucleoplasmic face, where the Ran--GTP levels are predicted to be high, Nup2p binds to Nup60p. Deletion of NUP60 renders Nup2p nucleoplasmic and compromises Nup2p-mediated recycling of Kap60p/Srp1p. Depletion of Ran--GTP by metabolic poisoning, disruption of the Ran cycle, or in vitro by cell lysis, results in a shift of Nup2p from the nucleoplasm to the cytoplasmic face of the NPC. This mobility of Nup2p was also detected using heterokaryons where, unlike nucleoporins, Nup2p was observed to move from one nucleus to the other. Together, our data support a model in which Nup2p movement facilitates the transition between the import and export phases of nucleocytoplasmic transport.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations167
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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