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Enregistrement W2143466555 · doi:10.1128/jb.187.23.7918-7930.2005

A Positive Regulatory Loop Controls Expression of the Locus of Enterocyte Effacement-Encoded Regulators Ler and GrlA

2005· article· en· W2143466555 sur OpenAlex
Jeannette Barba‐León, Vı́ctor H. Bustamante, Mario Alberto Flores‐Valdez, Wanyin Deng, B. Brett Finlay, José L. Puente

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesDirección General de Asuntos del Personal Académico, Universidad Nacional Autónoma de MéxicoCanadian Institutes of Health ResearchHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologyPathogenicity islandCitrobacter rodentiumVirulenceRepressorGenePsychological repressionRegulation of gene expressionGeneticsEnteropathogenic Escherichia coliLocus (genetics)Transcriptional regulationPhenotypeTranscription factorGene expressionCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The formation of attaching and effacing (A/E) lesions on intestinal epithelial cells is an essential step in the pathogenesis of human enteropathogenic and enterohemorrhagic Escherichia coli and of the mouse pathogen Citrobacter rodentium. The genes required for the development of the A/E phenotype are located within a pathogenicity island known as the locus of enterocyte effacement (LEE). The LEE-encoded transcriptional regulators Ler, an H-NS-like protein, and GrlA, a member of a novel family of transcriptional activators, positively control the expression of the genes located in the LEE and their corresponding virulence. In this study, we used C. rodentium as a model to study the mechanisms controlling the expression of Ler and GrlA. By deletion analysis of the ler and grlRA regulatory regions and complementation experiments, negative and positive cis-acting regulatory motifs were identified that are essential for the regulation of both genes. This analysis confirmed that GrlA is required for the activation of ler, but it also showed that Ler is required for the expression of grlRA, revealing a novel regulatory loop controlling the optimal expression of virulence genes in A/E pathogens. Furthermore, our results indicate that Ler and GrlA induce the expression of each other by, at least in part, counteracting the repression mediated by H-NS. However, whereas GrlA is still required for the optimal expression of ler even in the absence of H-NS, Ler is not needed for the expression of grlRA in the absence of H-NS. This type of transcriptional positive regulatory loop represents a novel mechanism in pathogenic bacteria that is likely required to maintain an appropriate spatiotemporal transcriptional response during infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,117
Score d'incertitude au seuil0,297

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle