Lack of mitochondrial DNA divergence between chromosome races of the common shrew, <i>Sorex araneus</i>, in Sweden. Implications for interpreting chromosomal evolution and colonization history
Notice bibliographique
Résumé
The common shrew, Sorex araneus, has one of the most variable karyotypes among mammals, displaying numerous chromosome races throughout its distribution. The six chromosome races present in Sweden can be categorized in two different karyotypic groups, the west and north European karyotypic groups (western and northern). Three races belonging to the western group are considered to have arisen through whole arm reciprocal translocations (WARTs). Race formation through this process requires a bottleneck event. In the present study we sequenced a part of the mitochondrial DNA (mtDNA) genome to investigate molecular differences between the chromosome races in Sweden. We found no mtDNA differentiation between the mainland chromosome races or the karyotypic groups. Genetic variation is as large between populations within a race as between populations among the races or karyotypic groups, suggesting that the karyotypic groups might have originated in a common glacial refugium. The noticeable exception is the Oland race, which shows higher mtDNA diversity compared to the other Swedish races, indicating a divergent origin difficult to explain. Mitochondrial DNA variation in Sweden suggests that most haplotypes arose in situ and that the populations has undergone a rapid size expansion. Altogether, the mtDNA data are in agreement with the WART hypothesis, which still holds as the most plausible variant of karyotype evolution for three of the chromosome races of the common shrew in Sweden.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».