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Enregistrement W2143506243 · doi:10.1139/f02-066

Resistance to three pathogens in the endangered winter-run chinook salmon (<i>Oncorhynchus tshawytscha</i>): effects of inbreeding and major histocompatibility complex genotypes

2002· article· en· W2143506243 sur OpenAlexvenueno aff
Kristen D. Arkush, Alan R. Giese, Holly L. Mendonca, Anne M McBride, Gary D. Marty, Philip W. Hedrick

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Marine Fisheries ServiceUniversity of California, DavisU.S. Fish and Wildlife Service
Mots-clésBiologyOncorhynchusInfectious hematopoietic necrosis virusChinook windInbreeding depressionGeneticsZoologyInbreedingRainbow troutPopulationFisheryFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have carried out the first major infectivity trial to examine differential genetic resistance in fish for pathogens. We used captive-bred, endangered winter-run chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha) to determine resistance to three pathogens: the bacterium, Listonella (Vibrio) anguillarum, infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV), and Myxobolus cerebralis, the parasite that causes whirling disease. We compared resistance to these three pathogens between inbred and outbred salmon and between siblings that were heterozygous or homozygous for a class II gene in the major histocompatibility complex (MHC). In two of five different comparisons, we found significant genetic effects on disease resistance. First, MHC heterozygotes had a higher survival than MHC homozygotes when exposed to IHNV and the selection disadvantage of homozygotes was estimated to be 8.5%. Second, outbred fish had a higher resistance (or lower infection severity) than inbred fish when exposed to M. cerebralis. Using a quantitative genetics approach, it appears that there are slightly more than three gene equivalents segregating that would result in no resistance to M. cerebralis when homozygous. Overall, our investigation suggests that pathogen susceptibility in the winter-run chinook salmon will increase if further genetic variation is lost in this endangered species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,359
Score d'incertitude au seuil0,950

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations184
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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