Metabonomic analysis of exhaled breath condensate in adults by nuclear magnetic resonance spectroscopy
Notice bibliographique
Résumé
Exhaled breath condensate (EBC) is a noninvasive method for the study of airway lining fluid. Nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy can provide biochemical profiles of metabolites in biological samples. The aim of the present study was to validate the NMR metabonomic analysis of EBC in adults, assessing the role of pre-analytical variables (saliva and disinfectant contamination) and the potential clinical feasibility. In total, 36 paired EBC and saliva samples, obtained from healthy subjects, laryngectomised patients and chronic obstructive pulmonary disease patients, were analysed by means of (1)H-NMR spectroscopy followed by principal component analysis. The effect on EBC of disinfectant, used for reusable parts of the condenser, was assessed after different washing procedures. To evaluate intra-day repeatability, eight subjects were asked to collect EBC and saliva twice within the same day. All NMR saliva spectra were significantly different from corresponding EBC samples. EBC taken from condensers washed with recommended procedures invariably showed spectra perturbed by disinfectant. Each EBC sample clustered with corresponding samples of the same group, while presenting intergroup qualitative and quantitative signal differences (94% of the total variance within the data). In conclusion, the nuclear magnetic resonance metabonomic approach could identify the metabolic fingerprint of exhaled breath condensate in different clinical sets of data. Moreover, metabonomics of exhaled breath condensate in adults can discriminate potential perturbations induced by pre-analytical variables.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».