MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2143574945 · doi:10.1002/jnr.22409

Aminoglycoside‐mediated partial suppression of <i>MECP2</i> nonsense mutations responsible for Rett syndrome in vitro

2010· article· en· W2143574945 sur OpenAlexafffund
Andreea C. Popescu, Elena Sidorova, Guangming Zhang, James H. Eubanks

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésRett syndromeNonsense mutationMECP2Context (archaeology)NonsensePoint mutationMutationAminoglycosideNeurodevelopmental disorderGeneticsBiologyGenePhenotypeAntibioticsMissense mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rett syndrome is a pediatric neurological condition that affects primarily girls. Approximately 30% of Rett syndrome cases arise from point mutations that introduce a premature stop codon into the MECP2 gene. Several studies have now shown that certain aminoglycosides can facilitate read-through of some types of nonsense mutations in a context-dependent manner and allow the generation of a full-length protein. It remains mostly unclear whether different nonsense mutations of MECP2 will be responsive to aminoglycoside treatment. In this study, we tested whether the common premature terminating mutations of MECP2 seen in Rett syndrome cases can be partially suppressed by aminoglycoside administration. Our results show that aminoglycosides allow different mutant forms of MECP2 to be overcome in transiently transfected HEK293 cells, but with differing levels of efficiency. In addition, we also show that aminoglycosides increased the prevalence of full-length MeCP2 protein in a dose-dependent manner in a lymphocyte cell line derived from a Rett syndrome girl with the R255X mutation. This study helps to establish the "proof of principle" that some nonsense mutations causing Rett syndrome can be at least partially suppressed by drug treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil0,292

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Neuroscience ResearchMême sujetGenetics and Neurodevelopmental DisordersTravaux en français237 207